38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0057 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0057  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2143  hypothetical protein  42.69 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.898454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14990  putative anti-SigV factor  38.75 
 
 
197 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.008664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  36.49 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  28.17 
 
 
253 aa  79  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  32.62 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  32.67 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  32.26 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  28.9 
 
 
452 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2311  hypothetical protein  30.22 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  29 
 
 
247 aa  62.4  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  27.49 
 
 
247 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  34.11 
 
 
247 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  34.11 
 
 
247 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  26.64 
 
 
480 aa  61.6  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  28.74 
 
 
315 aa  61.6  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  36.13 
 
 
247 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  36.13 
 
 
247 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  28.36 
 
 
247 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  36.13 
 
 
247 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4194  hypothetical protein  32.28 
 
 
265 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  35.29 
 
 
247 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  35.29 
 
 
247 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1580  hypothetical protein  35.29 
 
 
303 aa  55.1  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.77857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1437  hypothetical protein  29.74 
 
 
300 aa  54.7  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2574  hypothetical protein  27.6 
 
 
285 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.829838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4072  hypothetical protein  21.89 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998526  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  29.55 
 
 
281 aa  48.5  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1093  hypothetical protein  27.05 
 
 
301 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000595703  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  24.58 
 
 
251 aa  45.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0767  hypothetical protein  28.26 
 
 
231 aa  45.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0032  hypothetical protein  28.7 
 
 
236 aa  44.3  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000631349  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0749  hypothetical protein  27.17 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  22.73 
 
 
247 aa  43.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1894  hypothetical protein  25.14 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  25 
 
 
284 aa  42.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1308  hypothetical protein  28.36 
 
 
281 aa  42.4  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  29.31 
 
 
272 aa  41.6  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>