36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0052 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0052  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  863    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.115032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0051  hypothetical protein  53.16 
 
 
419 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2402  hypothetical protein  44.12 
 
 
443 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0964182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0513  hypothetical protein  38.44 
 
 
490 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2359  GTP-binding protein  36.25 
 
 
410 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.609724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00830  hypothetical protein  38.44 
 
 
380 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2171  GTP-binding protein  36.34 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1829  hypothetical protein  36.34 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121539  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  37.79 
 
 
681 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  37.21 
 
 
680 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1139  hypothetical protein  31.4 
 
 
438 aa  193  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000332623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0026  hypothetical protein  35.59 
 
 
607 aa  191  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0048296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1192  hypothetical protein  37.54 
 
 
679 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000450505  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0926  hypothetical protein  30.95 
 
 
419 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1068  hypothetical protein  32.54 
 
 
410 aa  182  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3228  GTP-binding protein  32.77 
 
 
463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6215  hypothetical protein  33.33 
 
 
418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3112  hypothetical protein  32.77 
 
 
590 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1450  hypothetical protein  33.14 
 
 
619 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2344  hypothetical protein  32.5 
 
 
463 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.896177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1361  hypothetical protein  32.5 
 
 
463 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1078  hypothetical protein  32.5 
 
 
463 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2054  hypothetical protein  32.5 
 
 
463 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.48739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2056  hypothetical protein  32.34 
 
 
540 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00919079  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5873  hypothetical protein  33.33 
 
 
418 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24530  hypothetical protein  33.99 
 
 
504 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2323  hypothetical protein  30.94 
 
 
461 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4540  protein of unknown function DUF187  34.23 
 
 
427 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0126264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4407  protein of unknown function DUF187  34.23 
 
 
427 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5606  hypothetical protein  32.55 
 
 
418 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278011  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  30.84 
 
 
693 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2182  hypothetical protein  30.09 
 
 
666 aa  133  6.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5916  hypothetical protein  27.94 
 
 
446 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.79067 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0164  hypothetical protein  30.81 
 
 
614 aa  118  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000289397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0573  hypothetical protein  26.95 
 
 
479 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1171  hypothetical protein  41.86 
 
 
202 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>