138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0045 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  100 
 
 
269 aa  547  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  83.27 
 
 
269 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  83.64 
 
 
269 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  81.04 
 
 
269 aa  448  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  81.68 
 
 
262 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  51 
 
 
262 aa  245  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  50 
 
 
266 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  50.79 
 
 
267 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  59.03 
 
 
323 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  39.18 
 
 
591 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.44 
 
 
431 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.51 
 
 
657 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  34.57 
 
 
182 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  41.13 
 
 
535 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  40.58 
 
 
340 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  39.58 
 
 
282 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  39.73 
 
 
481 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.29 
 
 
657 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  39.22 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  31.6 
 
 
452 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  43.97 
 
 
495 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  36.36 
 
 
323 aa  87.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.23 
 
 
907 aa  86.3  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  37.32 
 
 
418 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  37.59 
 
 
276 aa  85.9  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  33.58 
 
 
502 aa  85.5  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  40.32 
 
 
304 aa  85.5  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  35.25 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  41.07 
 
 
529 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  37.17 
 
 
281 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  38.39 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  41.35 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  38.94 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  33.74 
 
 
450 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  32.45 
 
 
451 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  32.72 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  40.18 
 
 
113 aa  79  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  37.17 
 
 
792 aa  79  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  37.12 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  42.72 
 
 
298 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  37.11 
 
 
553 aa  76.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  30.41 
 
 
451 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  31.39 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  35.78 
 
 
414 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  39.66 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  39.47 
 
 
948 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  39.36 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  37.23 
 
 
447 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  38.32 
 
 
650 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  36.28 
 
 
1176 aa  72.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  30.26 
 
 
625 aa  73.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  38.1 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  36.26 
 
 
845 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  35.58 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  35.92 
 
 
474 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  32.12 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.164538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  33.91 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  36.04 
 
 
763 aa  69.7  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  35.14 
 
 
426 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  32.14 
 
 
652 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  38 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  38.14 
 
 
732 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  36.94 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 
547 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  34.31 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  32.74 
 
 
763 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  35.04 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  27.27 
 
 
454 aa  66.2  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  26.09 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  37.96 
 
 
465 aa  65.5  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  31 
 
 
514 aa  65.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2343  copper amine oxidase-like  35.96 
 
 
751 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  30.32 
 
 
153 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  36.52 
 
 
480 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  32.85 
 
 
456 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  31.58 
 
 
704 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  32.38 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  29.92 
 
 
343 aa  63.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2097  copper amine oxidase domain protein  26.32 
 
 
258 aa  62.4  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.440325  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  32.64 
 
 
331 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  34.75 
 
 
758 aa  62.4  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  32.14 
 
 
292 aa  62.4  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  34.83 
 
 
501 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  35.29 
 
 
421 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  32.41 
 
 
423 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  29.13 
 
 
549 aa  60.1  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  32.48 
 
 
541 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  32.04 
 
 
741 aa  59.3  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  31.91 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  27.96 
 
 
319 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
784 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0384  copper amine oxidase domain-containing protein  29.24 
 
 
206 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2648  copper amine oxidase domain protein  36.11 
 
 
620 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2788  copper amine oxidase domain-containing protein  36.45 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  26.99 
 
 
589 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  32.69 
 
 
781 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2591  copper amine oxidase domain protein  28.32 
 
 
298 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.066327  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  34.38 
 
 
372 aa  55.8  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  28.83 
 
 
521 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  33.67 
 
 
718 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>