More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0037 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
142 aa  290  7e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  46 
 
 
150 aa  127  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
144 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  45.8 
 
 
148 aa  120  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  49.63 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  43.7 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  41.26 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  37.67 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  41.38 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  36.05 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  45.61 
 
 
145 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
173 aa  106  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
138 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
154 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
142 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
143 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
149 aa  104  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
148 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  40 
 
 
146 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
148 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  43.97 
 
 
148 aa  102  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
148 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  42.73 
 
 
153 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
147 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
146 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
180 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34.25 
 
 
147 aa  100  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  34.44 
 
 
230 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  33.77 
 
 
218 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
147 aa  99  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 
163 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  31.47 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  41.74 
 
 
187 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  31.47 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  41.74 
 
 
187 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  45.19 
 
 
178 aa  94  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 
173 aa  93.6  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  40.87 
 
 
187 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 
168 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  39.16 
 
 
149 aa  93.2  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  38.62 
 
 
195 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  39.84 
 
 
169 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  45.63 
 
 
178 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 
158 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  39.2 
 
 
143 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  36.91 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 
166 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 
158 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3725  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.843054  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  38.81 
 
 
142 aa  90.5  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  38.97 
 
 
169 aa  90.1  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
191 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  41.41 
 
 
513 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  38.13 
 
 
151 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  45 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  41.41 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  41.41 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  41.41 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  41.41 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  41.41 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  41.41 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  41.41 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  40.58 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  37.23 
 
 
167 aa  87.8  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  40.58 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  32.72 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  38.26 
 
 
185 aa  87.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
169 aa  87  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 
170 aa  87  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
166 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
165 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  42.03 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  42.03 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  42.31 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
162 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.57 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  41.58 
 
 
170 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  29.86 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  33.57 
 
 
162 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>