25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0027 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0027  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  252  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  32.26 
 
 		 244 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  32.26 
 
 		 244 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  24.39 
 
 		 292 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  25.2 
 
 		 309 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  25.2 
 
 		 309 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  23.81 
 
 		 339 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  28.89 
 
 		 300 aa  43.9  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  23.93 
 
 		 266 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  27.66 
 
 		 296 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  25.22 
 
 		 295 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  26.61 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  24.07 
 
 		 292 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  25.3 
 
 		 285 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  24.19 
 
 		 287 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2622  putative 4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.41 
 
 		 259 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.296225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  31.46 
 
 		 291 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>