29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0019 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0019  P-II family regulatory protein  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000803285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1788  nitrogen regulatory protein P-II  49.48 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000022602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0322  P-II family regulatory protein  41.24 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2614  nitrogen regulatory protein P-II  36.89 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.103962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1144  nitrogen regulatory protein P-II  37.76 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024925  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1465  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  28.89 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0344  nitrogen regulatory protein P-II  31.87 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1593  putative nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0343  PII family protein  29.41 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662152 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0166  hypothetical protein  38 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3140  nitrogen regulatory protein P-II  31.37 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0473  nitrogen regulatory protein P-II  30.43 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  29.67 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180511  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1722  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  28.12 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1222  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  36.05 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2273  putative nitrogen regulatory protein P-II  34 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000994598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1830  hypothetical protein  26.32 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.705773  hitchhiker  0.0000359774 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1828  putative nitrogen regulatory protein P-II  38.82 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1499  putative nitrogen regulatory protein P-II  35 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.689557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0747  nitrogen regulatory protein P-II  31.87 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00943314  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004144  nitrogen regulatory protein P-II  36.05 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2760  putative nitrogen regulatory protein P-II  38.37 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322157  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1951  hypothetical protein  34 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0909  hypothetical protein  33.7 
 
 		 240 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0660  hypothetical protein  23.81 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0654135  normal  0.148222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1089  hypothetical protein  22.22 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3477  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  31.68 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0803  hypothetical protein  21.43 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0801  hypothetical protein  26.26 
 
 		 127 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>