192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3276 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  41.67 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  53.19 
 
 
200 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  43.01 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  42.46 
 
 
210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  39.43 
 
 
206 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  43.02 
 
 
210 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  38.89 
 
 
204 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  45.25 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  42.29 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  37.78 
 
 
204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  42.29 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  39.44 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  36.67 
 
 
204 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  39.44 
 
 
212 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  38.73 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  41.67 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  41.4 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  44.1 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  38.05 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  38.8 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  38.67 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  38.67 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  38.25 
 
 
200 aa  118  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  37.78 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  40.76 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  40.45 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  38.25 
 
 
228 aa  115  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  38.25 
 
 
228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  39.11 
 
 
200 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  39.33 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  40.78 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  39.77 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  39.11 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  39.2 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  37.57 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  34.44 
 
 
257 aa  111  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  32.22 
 
 
217 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  37.99 
 
 
202 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  33.89 
 
 
217 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  35.84 
 
 
238 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  38.5 
 
 
237 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  35.42 
 
 
202 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  39.23 
 
 
203 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  41.01 
 
 
211 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  34.74 
 
 
202 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  41.01 
 
 
211 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  41.01 
 
 
211 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  31.69 
 
 
215 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  38.64 
 
 
214 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  37.64 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  43.18 
 
 
233 aa  95.1  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  34.83 
 
 
204 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  30 
 
 
215 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  39.87 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  35.71 
 
 
292 aa  86.3  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  35.8 
 
 
202 aa  85.1  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  39.1 
 
 
239 aa  82  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  26.86 
 
 
294 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  35.39 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  30.49 
 
 
281 aa  72  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  27.46 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  27.5 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  28.49 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2107  Protein of unknown function DUF2179  28.8 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0670026 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  28.06 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  31.08 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  25.44 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  27.97 
 
 
314 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  31.45 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  29.01 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  27.56 
 
 
295 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0743  hypothetical protein  25 
 
 
279 aa  62.8  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108912  hitchhiker  0.0000688961 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  24.57 
 
 
292 aa  62.8  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  25.93 
 
 
323 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  27.89 
 
 
287 aa  61.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  25.44 
 
 
283 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  22.03 
 
 
290 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1380  hypothetical protein  26.95 
 
 
285 aa  59.7  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000107649  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  27.15 
 
 
309 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  28 
 
 
313 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  24.69 
 
 
296 aa  58.5  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  30.97 
 
 
290 aa  58.9  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  30.97 
 
 
283 aa  58.5  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2110  hypothetical protein  29.56 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  27.71 
 
 
302 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0771  hypothetical protein  25 
 
 
283 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103591  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  29.09 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  25 
 
 
311 aa  57  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  27.78 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  32.35 
 
 
288 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  24.52 
 
 
322 aa  56.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1039  hypothetical protein  27.34 
 
 
315 aa  55.8  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0295  hypothetical protein  29.37 
 
 
285 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  27.16 
 
 
285 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0290  hypothetical protein  28.67 
 
 
285 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000120699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0880  hypothetical protein  31.01 
 
 
285 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0930  hypothetical protein  28.24 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0214742  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  27.16 
 
 
278 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0748  hypothetical protein  26.2 
 
 
283 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0644757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>