169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3231 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3231  dihydroorotase  100 
 
 
351 aa  722    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  66.95 
 
 
348 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  66.18 
 
 
348 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  67.83 
 
 
349 aa  478  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  66.28 
 
 
347 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2209  dihydroorotase  66.47 
 
 
348 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194064  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  65.61 
 
 
348 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1231  dihydroorotase  66.18 
 
 
348 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.905188  normal  0.395002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2025  dihydroorotase  66.47 
 
 
348 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  65.61 
 
 
348 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1260  dihydroorotase  65.9 
 
 
348 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.374418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  65.61 
 
 
347 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  65.61 
 
 
348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  65.9 
 
 
348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1185  dihydroorotase  65.61 
 
 
348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2538  dihydroorotase  65.61 
 
 
348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.223191  normal  0.326474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  65.61 
 
 
348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1275  dihydroorotase  65.61 
 
 
348 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.78408 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  65.61 
 
 
348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  65.61 
 
 
348 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1441  dihydroorotase  65.61 
 
 
348 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.426148  normal  0.0213207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2265  dihydroorotase  65.61 
 
 
348 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  64.74 
 
 
347 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1576  dihydroorotase  65.61 
 
 
348 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0441  dihydroorotase  60.17 
 
 
364 aa  433  1e-120  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.373493  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  60.23 
 
 
346 aa  421  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  60.65 
 
 
340 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  59.47 
 
 
348 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  59.47 
 
 
348 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  58.88 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  60.93 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18131  dihydroorotase  56.53 
 
 
354 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.085007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  58.58 
 
 
348 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  58.58 
 
 
344 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  54.68 
 
 
346 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  57.69 
 
 
347 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  57.4 
 
 
348 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  58.88 
 
 
344 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  57.35 
 
 
348 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05731  dihydroorotase  53.09 
 
 
357 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.501283  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  57.27 
 
 
348 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  57.4 
 
 
347 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  57.97 
 
 
348 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1742  dihydroorotase  57.77 
 
 
347 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119262  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  57.31 
 
 
345 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  56.27 
 
 
350 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  56.76 
 
 
348 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  55.88 
 
 
348 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  55.11 
 
 
352 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  55.59 
 
 
364 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  55.78 
 
 
346 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  57.35 
 
 
343 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  55.56 
 
 
345 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  55.59 
 
 
364 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  55.59 
 
 
354 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  55.3 
 
 
354 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  55.1 
 
 
366 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  55.3 
 
 
354 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  55.01 
 
 
354 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  55.01 
 
 
364 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  52.79 
 
 
342 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0005  dihydroorotase  52.42 
 
 
354 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  56.38 
 
 
344 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  55.72 
 
 
346 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  53.96 
 
 
343 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06241  dihydroorotase  52.14 
 
 
354 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104893  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0129  dihydroorotase  55.98 
 
 
346 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.969204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  56.38 
 
 
344 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0130  dihydroorotase  55.72 
 
 
348 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  56.08 
 
 
344 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  53.39 
 
 
355 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  53.08 
 
 
342 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  54.09 
 
 
345 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  52.31 
 
 
347 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  52.31 
 
 
347 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  52.31 
 
 
347 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  53.67 
 
 
342 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  52.2 
 
 
343 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  52.94 
 
 
343 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2371  dihydroorotase  56.43 
 
 
345 aa  374  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.860009  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  53.67 
 
 
348 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  51.17 
 
 
351 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  54.52 
 
 
344 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  53.39 
 
 
344 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1592  dihydroorotase  54.39 
 
 
343 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060522  normal  0.517158 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  52.79 
 
 
342 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  56.08 
 
 
345 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5321  dihydroorotase  54.84 
 
 
359 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  54.25 
 
 
342 aa  371  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3761  dihydroorotase  54.07 
 
 
344 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.793108  hitchhiker  0.00208859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  54.17 
 
 
347 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  53.51 
 
 
345 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0524  dihydroorotase  54.52 
 
 
350 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3595  dihydroorotase  52.62 
 
 
344 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  53.6 
 
 
352 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  52.89 
 
 
359 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1475  dihydroorotase  54.84 
 
 
346 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623484  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  53.51 
 
 
359 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  55.39 
 
 
348 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  53.41 
 
 
347 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>