More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3199 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  48.15 
 
 		 263 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  51.24 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  49.26 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  48.15 
 
 		 263 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  47.57 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  47.57 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  47.09 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 234 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 275 aa  198  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  47.57 
 
 		 241 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  46.6 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  46.08 
 
 		 231 aa  181  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  43.07 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 284 aa  168  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 231 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  45.15 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  36.2 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 295 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  39 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  34.11 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.84 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 242 aa  121  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 233 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2445  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.247601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 248 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  33.14 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>