More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3193 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  508  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  39.06 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  38.7 
 
 		 379 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5340  GntR domain protein  37.39 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0345729 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  36.32 
 
 		 241 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4324  GntR domain-containing protein  37.87 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133049 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  32.19 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  32.62 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  32.62 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  32.62 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  32.62 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  32.19 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  32.19 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  32.19 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  32.19 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  32.19 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  32.19 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  32.19 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  32.19 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  32.19 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  32.19 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  30.73 
 
 		 252 aa  98.2  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.04 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  30.36 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  33.77 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  30.57 
 
 		 235 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  30.6 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.22 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  29.6 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  30.04 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.3 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  29.39 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  28.94 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3837  transcriptional regulator NanR  29.17 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  28.57 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.57 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1066  transcriptional regulator NanR  30.35 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624285  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29.82 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  29.03 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  30.73 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  26.27 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  30.09 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  29.65 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  30.2 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3776  regulatory protein GntR HTH  27.31 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0209412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2539  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.824223  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  28.82 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  32.29 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  30.97 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  27.23 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  27.23 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  28.33 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  27.23 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  29.44 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  27.23 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  27.23 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  29.44 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  27.23 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  27.23 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  27.23 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  27.23 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  29.44 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  29.96 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  29.03 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  29.63 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  29.27 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  24.66 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  28.86 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  28.07 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  30.04 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  29.17 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  28.94 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  29.17 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2324  regulatory protein  34.18 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>