More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3177 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
247 aa  188  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  45.02 
 
 
264 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  47.56 
 
 
245 aa  184  1e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  47.48 
 
 
264 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  48.2 
 
 
234 aa  172  3e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  46.85 
 
 
234 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  46.58 
 
 
253 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  46.58 
 
 
238 aa  165  6e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  46.02 
 
 
258 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  37.97 
 
 
266 aa  159  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  44.64 
 
 
258 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  45.89 
 
 
234 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  42.86 
 
 
238 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  42.29 
 
 
288 aa  148  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  43.29 
 
 
234 aa  147  2e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
251 aa  146  4e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0437  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
234 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0578  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
234 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1919  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
234 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0889  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
234 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2012  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
234 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.888081  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  41.2 
 
 
255 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1856  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
234 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
274 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  37.83 
 
 
248 aa  141  1e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0978  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
234 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  38.7 
 
 
249 aa  139  4e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  40.99 
 
 
246 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  40.99 
 
 
246 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 
274 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  36.94 
 
 
246 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
254 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  38.7 
 
 
249 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  38.7 
 
 
249 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  37.83 
 
 
249 aa  136  3e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  37.83 
 
 
249 aa  135  6e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  43.29 
 
 
234 aa  135  7e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
272 aa  134  2e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
255 aa  133  2e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0479  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
234 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558677  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
268 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
247 aa  130  1e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  39.01 
 
 
299 aa  130  2e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  37.99 
 
 
249 aa  130  2e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5154  GntR domain-containing protein  43.29 
 
 
234 aa  129  4e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3213  GntR-like  43.29 
 
 
234 aa  129  4e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  37.05 
 
 
284 aa  129  5e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  36.44 
 
 
253 aa  129  7e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
268 aa  128  7e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  37.44 
 
 
272 aa  128  9e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4549  GntR domain-containing protein  42.86 
 
 
234 aa  127  1e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  36.02 
 
 
273 aa  127  2e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  37.93 
 
 
254 aa  127  2e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  38.43 
 
 
273 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  9.57079e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  39.73 
 
 
238 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  35.34 
 
 
247 aa  125  4e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  37.05 
 
 
235 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
248 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5072  GntR domain-containing protein  42.42 
 
 
234 aa  125  8e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  37.5 
 
 
254 aa  125  8e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  36.1 
 
 
251 aa  125  8e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  37.5 
 
 
246 aa  125  8e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  35.83 
 
 
251 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  38.01 
 
 
229 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  37.77 
 
 
253 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 
249 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  37.5 
 
 
249 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 
249 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
240 aa  121  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
253 aa  121  1e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 
244 aa  120  2e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  36.32 
 
 
229 aa  120  2e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  37.17 
 
 
262 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  36.91 
 
 
253 aa  119  4e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  36.91 
 
 
253 aa  119  5e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  37.82 
 
 
252 aa  119  5e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  35.78 
 
 
232 aa  119  5e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
247 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
233 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
234 aa  118  8e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  36.04 
 
 
233 aa  117  1e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  36.13 
 
 
248 aa  118  1e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  33.33 
 
 
275 aa  117  2e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  34.17 
 
 
241 aa  117  2e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
233 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
270 aa  115  8e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  36.44 
 
 
243 aa  115  9e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  39.91 
 
 
236 aa  114  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.69 
 
 
239 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
235 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.9 
 
 
240 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  36.4 
 
 
242 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.3 
 
 
241 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  38.33 
 
 
250 aa  112  8e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29.91 
 
 
238 aa  111  1e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  39.06 
 
 
236 aa  110  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  37.07 
 
 
233 aa  110  2e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
252 aa  110  2e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  37.07 
 
 
233 aa  110  2e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>