More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3148 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  100 
 
 
493 aa  991    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  56.9 
 
 
498 aa  523  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  57.35 
 
 
502 aa  518  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  54.18 
 
 
494 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  50.51 
 
 
489 aa  481  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  53.56 
 
 
477 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  53.29 
 
 
477 aa  472  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  51.68 
 
 
503 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  51.68 
 
 
503 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  51.68 
 
 
503 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  51.68 
 
 
503 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  51.68 
 
 
503 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  52.1 
 
 
503 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  51.68 
 
 
503 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  51.68 
 
 
503 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  50.82 
 
 
483 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  53.91 
 
 
476 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  52.93 
 
 
470 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  51.37 
 
 
495 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  51.89 
 
 
504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  51.89 
 
 
504 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  51.89 
 
 
497 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  51.47 
 
 
502 aa  448  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  50.74 
 
 
480 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  51.33 
 
 
496 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  50.21 
 
 
485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  51.03 
 
 
492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  51.68 
 
 
497 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  51.68 
 
 
497 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  51.8 
 
 
471 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  50.42 
 
 
471 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  49.47 
 
 
493 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  47.73 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  47.25 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  47.43 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  47.64 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  47.64 
 
 
479 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  47.43 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  47.43 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  47.2 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  50.11 
 
 
488 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  47.23 
 
 
479 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  49.46 
 
 
458 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  52.64 
 
 
474 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  50 
 
 
466 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  47.23 
 
 
479 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  44.7 
 
 
475 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  47.26 
 
 
480 aa  433  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  47.23 
 
 
481 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  50.77 
 
 
470 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  49.26 
 
 
466 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3541  sodium:alanine symporter family protein  50.64 
 
 
488 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1148  amino acid carrier protein  50.64 
 
 
480 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209129  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2964  amino acid carrier protein  50.11 
 
 
488 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.302472  normal  0.844283 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  48.94 
 
 
480 aa  425  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3144  amino acid carrier protein  50.11 
 
 
488 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0262714  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3242  amino acid carrier protein  50.75 
 
 
480 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1052  amino acid carrier protein  50.64 
 
 
481 aa  425  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1114  amino acid carrier protein  50.64 
 
 
480 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000596574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  45.47 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0422  amino acid carrier family protein  49.48 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.797168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  46.11 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1047  amino acid carrier protein  50.43 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  45.47 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  45.47 
 
 
476 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  45.68 
 
 
476 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  45.89 
 
 
476 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  44.91 
 
 
476 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  45.89 
 
 
476 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  45.44 
 
 
485 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0539  amino acid carrier protein  45.49 
 
 
486 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0377619  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0483  amino acid carrier family protein  48.96 
 
 
477 aa  411  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489215  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  45.57 
 
 
483 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  45.44 
 
 
485 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0006  amino-acid carrier protein AlsT  45.44 
 
 
485 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0332289  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  45.44 
 
 
476 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557087  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0006  amino-acid carrier protein AlsT  45.44 
 
 
485 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  46.17 
 
 
457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  45.36 
 
 
483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2730  amino acid carrier protein  49.04 
 
 
504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000165436  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  46.2 
 
 
485 aa  401  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0706  sodium/alanine symporter family protein  45.07 
 
 
486 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0549  sodium/alanine symporter family protein  45.07 
 
 
486 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4664  sodium/alanine symporter family protein  44.86 
 
 
487 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36209e-20 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  46.41 
 
 
479 aa  401  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  44.47 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5996  amino acid carrier protein  49.47 
 
 
472 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.188928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0551  amino acid carrier protein  45.88 
 
 
480 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0569  amino acid carrier protein  45.65 
 
 
476 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.352189  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0539  amino acid carrier protein  46.06 
 
 
480 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  44.94 
 
 
477 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0549  sodium/alanine symporter family protein  44.86 
 
 
486 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0530  amino acid carrier protein  45.84 
 
 
480 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5626  Sodium:alanine symporter  45.88 
 
 
481 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28273  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0767  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  44.44 
 
 
487 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  44.94 
 
 
477 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4714  amino acid carrier protein  48.12 
 
 
484 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6060  amino acid carrier protein  49.47 
 
 
472 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186071  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0496  amino acid carrier protein  45.63 
 
 
480 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0638  sodium/alanine symporter family protein  44.65 
 
 
486 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>