More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3128 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3128  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 		 446 aa  909    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  63.96 
 
 		 449 aa  568  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  63.33 
 
 		 450 aa  566  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2768  NADH dehydrogenase I subunit F  63.72 
 
 		 449 aa  566  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  63.1 
 
 		 461 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  63.1 
 
 		 461 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  63.1 
 
 		 461 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.848425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02209  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F  62.38 
 
 		 445 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  62.38 
 
 		 445 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  62.38 
 
 		 445 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  62.38 
 
 		 445 aa  558  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2670  NADH dehydrogenase I subunit F  62.15 
 
 		 445 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.793863 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  62.15 
 
 		 445 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  62.15 
 
 		 445 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  62.15 
 
 		 445 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  62.15 
 
 		 445 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  62.15 
 
 		 445 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1398  NADH dehydrogenase I subunit F  64.57 
 
 		 449 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.940574  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  62.15 
 
 		 445 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2566  NADH dehydrogenase I subunit F  61.14 
 
 		 448 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  62.15 
 
 		 445 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  62.15 
 
 		 445 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  62.15 
 
 		 445 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1017  NADH dehydrogenase I subunit F  63.21 
 
 		 461 aa  551  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4123  NADH dehydrogenase I subunit F  59.91 
 
 		 453 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2416  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.97 
 
 		 448 aa  547  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0718255  normal  0.148536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2546  NADH dehydrogenase I subunit F  64.44 
 
 		 449 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1742  NADH dehydrogenase I subunit F  59.91 
 
 		 453 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00767478  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1869  NADH dehydrogenase I subunit F  61.32 
 
 		 458 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.123144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  61.07 
 
 		 445 aa  548  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3695  NADH dehydrogenase I subunit F  61.56 
 
 		 454 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3607  NADH dehydrogenase I subunit F  59.28 
 
 		 451 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28480  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.63 
 
 		 449 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3369  NADH dehydrogenase I, F subunit  60.61 
 
 		 452 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3201  NADH dehydrogenase I subunit F  60.14 
 
 		 452 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103684  normal  0.0135586 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0377  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.62 
 
 		 444 aa  529  1e-149  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.372414  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0588  NADH dehydrogenase I, F subunit  57.83 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0577  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.14 
 
 		 474 aa  490  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29970  NADH dehydrogenase I subunit F  56.46 
 
 		 449 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.82 
 
 		 429 aa  485  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  57.73 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1695  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.81 
 
 		 537 aa  484  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.316564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.72 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.18 
 
 		 425 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.94 
 
 		 426 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1116  NADH dehydrogenase (quinone)  56.01 
 
 		 434 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0714  NADH dehydrogenase (quinone)  58.57 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.16 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.32 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3441  NADH dehydrogenase I, F subunit  47 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.57 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0158  NADH dehydrogenase (quinone)  47.95 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589974 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0157  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  47 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0329  NADH dehydrogenase (quinone)  47.47 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4067  NADH dehydrogenase (quinone)  50.12 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0902793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0176  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  47.71 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1693  NADH dehydrogenase (quinone)  48.46 
 
 		 416 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0681624  normal  0.883791 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0208  NADH dehydrogenase I chain F  47.86 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1740  NADH dehydrogenase (quinone)  48.7 
 
 		 416 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0104  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  48.46 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.02 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.85 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.16 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.02 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.55 
 
 		 706 aa  371  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.26 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.98 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.17 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.98 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.47 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  46.35 
 
 		 426 aa  365  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.84 
 
 		 426 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  45.78 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.53 
 
 		 442 aa  363  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45 
 
 		 441 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.3 
 
 		 431 aa  362  8e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.27 
 
 		 425 aa  361  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.66 
 
 		 434 aa  360  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.91 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.19 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  47.92 
 
 		 438 aa  360  3e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.27 
 
 		 440 aa  359  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.39 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.61 
 
 		 448 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  46.33 
 
 		 424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  45.67 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.36 
 
 		 438 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.36 
 
 		 438 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.42 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.12 
 
 		 438 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49 
 
 		 439 aa  353  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  44.78 
 
 		 428 aa  352  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1279  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  45.82 
 
 		 438 aa  353  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  45.86 
 
 		 449 aa  352  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.16 
 
 		 446 aa  352  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1880  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.86 
 
 		 441 aa  352  8e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  44.86 
 
 		 539 aa  352  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  43.56 
 
 		 425 aa  351  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  43.56 
 
 		 425 aa  351  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1330  NADH dehydrogenase (quinone)  50.86 
 
 		 428 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>