More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3096 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 557 aa  1099    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  51.79 
 
 		 559 aa  551  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  51.17 
 
 		 558 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  50.72 
 
 		 558 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  50.71 
 
 		 557 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  50.63 
 
 		 558 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  49.73 
 
 		 557 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  49.37 
 
 		 557 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  50.63 
 
 		 557 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  50.09 
 
 		 557 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  50.09 
 
 		 557 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  49.91 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  50.27 
 
 		 557 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  46.22 
 
 		 556 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.73 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  45.95 
 
 		 554 aa  477  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  42.96 
 
 		 553 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  42.27 
 
 		 557 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  44.68 
 
 		 554 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  44.32 
 
 		 554 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  46.26 
 
 		 567 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  43.76 
 
 		 552 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  44.4 
 
 		 553 aa  452  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  43.48 
 
 		 552 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  45.06 
 
 		 554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  43.58 
 
 		 552 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  43.58 
 
 		 552 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  43.58 
 
 		 552 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  43.48 
 
 		 552 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  42.47 
 
 		 552 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  43.58 
 
 		 552 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02270  DNA repair ATPase RecN  44.01 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  42.93 
 
 		 552 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  43.3 
 
 		 552 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  42.1 
 
 		 553 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  43.78 
 
 		 554 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  41.37 
 
 		 565 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0914  DNA repair protein RecN  43.45 
 
 		 558 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.473015  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  44.54 
 
 		 553 aa  435  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  44.36 
 
 		 553 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  44.36 
 
 		 553 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  45.8 
 
 		 553 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  42.83 
 
 		 553 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  44.29 
 
 		 553 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  45.06 
 
 		 568 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  44.86 
 
 		 568 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  43.86 
 
 		 559 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  44.54 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  44.09 
 
 		 553 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  42.78 
 
 		 555 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  40.54 
 
 		 559 aa  418  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  45.8 
 
 		 564 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  44.01 
 
 		 553 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  45.14 
 
 		 569 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  44.55 
 
 		 557 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  41.73 
 
 		 563 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  42.11 
 
 		 553 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  44.56 
 
 		 553 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  42.7 
 
 		 553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  44.78 
 
 		 558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  42.7 
 
 		 553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  42.52 
 
 		 553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  42.52 
 
 		 553 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  42.06 
 
 		 553 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  38.85 
 
 		 555 aa  405  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  39.1 
 
 		 555 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  42.52 
 
 		 553 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  42.06 
 
 		 553 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  42.06 
 
 		 553 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  42.52 
 
 		 553 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  42.06 
 
 		 553 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  42.52 
 
 		 553 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  42.06 
 
 		 553 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  42.52 
 
 		 553 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 		 561 aa  402  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  42.34 
 
 		 553 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  43.11 
 
 		 576 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  42.15 
 
 		 589 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  42.47 
 
 		 552 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  42.81 
 
 		 554 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  42.91 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  38.02 
 
 		 608 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  37.84 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  41.08 
 
 		 557 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  42.96 
 
 		 556 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1726  DNA repair protein RecN  45.19 
 
 		 551 aa  382  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.995264  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  38.85 
 
 		 556 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  41.35 
 
 		 549 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  44.27 
 
 		 559 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  41.83 
 
 		 553 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  41.23 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  41.23 
 
 		 549 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  41.23 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  40.26 
 
 		 547 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  41.41 
 
 		 591 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  40.51 
 
 		 549 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  41.23 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  41.23 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  40.51 
 
 		 549 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  41.23 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>