More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3078 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3078  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417746  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  53.57 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  53.39 
 
 		 250 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  50.6 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  48.79 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  47.06 
 
 		 260 aa  231  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  46.67 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 260 aa  230  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 260 aa  229  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  46.27 
 
 		 260 aa  229  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  46.27 
 
 		 260 aa  229  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  50.59 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  51.65 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 272 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 251 aa  224  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 		 249 aa  224  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 256 aa  222  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0169  triosephosphate isomerase  42 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  42.74 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  48.56 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 		 266 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 		 266 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 		 266 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 		 266 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  48.1 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  48.56 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 255 aa  214  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  44.8 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  51.64 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  44.8 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.99 
 
 		 655 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3612  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  50.59 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 253 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.12 
 
 		 650 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  46.59 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>