224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3004 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 
450 aa  910    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3092  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  39.04 
 
 
450 aa  308  9e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148936 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  38.63 
 
 
450 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.918562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  39.69 
 
 
364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  36.51 
 
 
429 aa  267  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03551  outer membrane protein  34.44 
 
 
446 aa  262  8e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  34.67 
 
 
450 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0306  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  35.29 
 
 
449 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126384 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0068  aromatic hydrocarbon degradation protein  32.94 
 
 
417 aa  244  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.952244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  32.89 
 
 
423 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.31 
 
 
424 aa  240  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2706  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  35.25 
 
 
400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  35.17 
 
 
405 aa  230  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.97 
 
 
442 aa  230  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0328  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.37 
 
 
447 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.67 
 
 
430 aa  219  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  30.3 
 
 
421 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2562  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32 
 
 
429 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000928224  hitchhiker  0.000000000130731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  30.62 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.87 
 
 
421 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.22 
 
 
421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  28.76 
 
 
424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0350  aromatic hydrocarbon degradation protein  31.11 
 
 
401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000805243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1548  aromatic hydrocarbon degradation protein  31.09 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000033121  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  32.24 
 
 
422 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.63 
 
 
427 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0035  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.18 
 
 
459 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05747  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002851  long-chain fatty acid transport protein  31.33 
 
 
442 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4030  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.54 
 
 
426 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150189  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  30.48 
 
 
429 aa  207  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0539  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  34.58 
 
 
488 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3839  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32 
 
 
430 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03834  Long-chain fatty acid transport protein  29.72 
 
 
464 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000417169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3584  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32 
 
 
448 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4441  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.24 
 
 
437 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526852 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0372  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.58 
 
 
448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.75 
 
 
415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0397  long-chain fatty acid transport protein  30.49 
 
 
445 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3816  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32 
 
 
450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1288  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.46 
 
 
565 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2013  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  32.13 
 
 
432 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4102  outer membrane protein  29.82 
 
 
429 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4546  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.59 
 
 
432 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495383  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.92 
 
 
419 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4232  long-chain fatty acid transport protein  30.59 
 
 
437 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  29.19 
 
 
424 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3757  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.3 
 
 
449 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0902024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0698  long-chain fatty acid transport protein  30.85 
 
 
419 aa  189  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0389  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.88 
 
 
449 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3824  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.17 
 
 
428 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0415  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.88 
 
 
449 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2174  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32 
 
 
410 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.67 
 
 
449 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000690815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0390  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.88 
 
 
449 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2270  outer membrane protein transport protein  30.23 
 
 
438 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000125338  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0475  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.91 
 
 
451 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60730  putative outer membrane protein  29.34 
 
 
463 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0340  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.08 
 
 
450 aa  186  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3342  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.41 
 
 
436 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15331  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0374  long-chain fatty acid transport protein  32.01 
 
 
412 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0560  long-chain fatty acid transport protein  27.65 
 
 
432 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00871251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3234  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.59 
 
 
420 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3468  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.56 
 
 
451 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0385  long-chain fatty acid outer membrane transporter  30.4 
 
 
421 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0339  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.62 
 
 
452 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000148311  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1397  long-chain fatty acid outer membrane transporter  30.4 
 
 
421 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2609  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.69 
 
 
439 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000112018  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1506  long-chain fatty acid outer membrane transporter  30.4 
 
 
421 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0138985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3381  long-chain fatty acid outer membrane transporter  28.92 
 
 
440 aa  177  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2884  long-chain fatty acid outer membrane transporter  31.01 
 
 
444 aa  176  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576882  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  28.13 
 
 
422 aa  176  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1993  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.46 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2824  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.21 
 
 
427 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1710  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.09 
 
 
430 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2436  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.16 
 
 
438 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000365967  hitchhiker  0.00491561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.57 
 
 
424 aa  171  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0500  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.44 
 
 
420 aa  171  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2178  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.74 
 
 
440 aa  171  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000636439  normal  0.0847993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1252  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.54 
 
 
446 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000958296  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.24 
 
 
417 aa  169  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5070  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.79 
 
 
437 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1414  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.39 
 
 
443 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000739159  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05817  hypothetical protein  28.67 
 
 
414 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2687  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.79 
 
 
427 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000955558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.5 
 
 
415 aa  167  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1548  outer membrane protein P1  26.45 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000809472  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1410  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.11 
 
 
406 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.343268  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0104  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.79 
 
 
439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.21 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5229  outer membrane protein  27.12 
 
 
482 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3046  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.91 
 
 
430 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2620  long-chain fatty acid outer membrane transporter  30.1 
 
 
437 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0208452  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2634  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.26 
 
 
437 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0127967  hitchhiker  0.00000000000285546 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2745  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.49 
 
 
435 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00852795  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2580  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.49 
 
 
435 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00696507  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2708  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.44 
 
 
413 aa  156  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2724  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.78 
 
 
446 aa  156  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2531  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.49 
 
 
435 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2495  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.78 
 
 
446 aa  156  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0065  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.23 
 
 
428 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.709413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>