More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2990 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  455  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  54.26 
 
 
199 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  49.75 
 
 
220 aa  181  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  49.75 
 
 
220 aa  181  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  49.75 
 
 
220 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  51.81 
 
 
207 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  51.58 
 
 
191 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  51.58 
 
 
191 aa  175  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  52.2 
 
 
206 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  51.63 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  51.63 
 
 
198 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  51.63 
 
 
198 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  51.63 
 
 
198 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  51.63 
 
 
198 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  49.74 
 
 
198 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  51.63 
 
 
198 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  51.09 
 
 
198 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  51.63 
 
 
198 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  50.28 
 
 
194 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  48.74 
 
 
201 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  44.71 
 
 
199 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  52.41 
 
 
199 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  49.17 
 
 
196 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  49.73 
 
 
200 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  45.23 
 
 
215 aa  165  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  45.7 
 
 
193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  49.17 
 
 
200 aa  164  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  46.94 
 
 
199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  47.83 
 
 
222 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  45.13 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  49.18 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  43.41 
 
 
199 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  44.04 
 
 
202 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  45.45 
 
 
209 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.33 
 
 
202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  45.13 
 
 
215 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.76 
 
 
207 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  45.32 
 
 
200 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.76 
 
 
207 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.76 
 
 
207 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.76 
 
 
207 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.76 
 
 
207 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  44.83 
 
 
200 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  44.86 
 
 
190 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  47.28 
 
 
202 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  46.96 
 
 
221 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  46.74 
 
 
222 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  46.74 
 
 
222 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  45.16 
 
 
193 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  44.33 
 
 
200 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  46.74 
 
 
222 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  41.2 
 
 
212 aa  155  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  43.17 
 
 
200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  46.15 
 
 
199 aa  154  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  47.25 
 
 
195 aa  154  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  46.77 
 
 
205 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  47.62 
 
 
211 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  49.44 
 
 
188 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  43.84 
 
 
200 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  51.15 
 
 
192 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  41.54 
 
 
216 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  51.16 
 
 
196 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  48.33 
 
 
209 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  50.25 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  45.36 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  47.51 
 
 
192 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  52.63 
 
 
205 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  43.84 
 
 
200 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  40.88 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  40.22 
 
 
194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  42.78 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  41.76 
 
 
193 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  44.26 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  41.76 
 
 
193 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  42.25 
 
 
208 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3870  putative methyltransferase  43.41 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  42.78 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  41.04 
 
 
228 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  45.32 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  44.51 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  43.65 
 
 
227 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  43.78 
 
 
204 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  41.99 
 
 
185 aa  125  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  43.78 
 
 
204 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1668  hypothetical protein  37.04 
 
 
220 aa  124  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  43.81 
 
 
204 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1746  hypothetical protein  35.48 
 
 
228 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00357447  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  44.56 
 
 
237 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2754  methyltransferase, putative  44.44 
 
 
189 aa  121  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  43.02 
 
 
184 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  44.44 
 
 
189 aa  121  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  42.33 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6138  hypothetical protein  42.29 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266752  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0244  methyltransferase  40.38 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0799  putative methyltransferase  33.48 
 
 
242 aa  118  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139027  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  44.2 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  41.57 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1925  putative methyltransferase  41.8 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  42.42 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  42.86 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>