More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2939 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
171 aa  355  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  69.23 
 
 
164 aa  233  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  68.59 
 
 
167 aa  230  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  68.59 
 
 
167 aa  230  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  66.46 
 
 
162 aa  229  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  66.05 
 
 
169 aa  222  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  66.88 
 
 
161 aa  221  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  69.74 
 
 
166 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  69.74 
 
 
166 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  66.22 
 
 
160 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  66.22 
 
 
188 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  68.42 
 
 
168 aa  217  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  68.06 
 
 
188 aa  215  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  65 
 
 
168 aa  215  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  65.82 
 
 
168 aa  214  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  67.97 
 
 
161 aa  213  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  66.22 
 
 
163 aa  213  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  65.54 
 
 
166 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  70.9 
 
 
161 aa  209  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  64.86 
 
 
166 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  61.33 
 
 
178 aa  208  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  62 
 
 
187 aa  208  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  66.03 
 
 
161 aa  207  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  63.69 
 
 
161 aa  207  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  66.22 
 
 
167 aa  206  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  70.15 
 
 
160 aa  204  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  65.16 
 
 
161 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  69.4 
 
 
161 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  62.76 
 
 
162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  76.79 
 
 
161 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  76.79 
 
 
161 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  63.83 
 
 
167 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  56.79 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  67.59 
 
 
162 aa  188  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  62.67 
 
 
153 aa  187  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  67.44 
 
 
180 aa  187  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  56.88 
 
 
173 aa  184  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  59.44 
 
 
146 aa  181  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  64.57 
 
 
161 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  66.17 
 
 
179 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  56.34 
 
 
178 aa  175  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  64.93 
 
 
176 aa  175  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
187 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  50.94 
 
 
185 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  54.05 
 
 
182 aa  158  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  46.79 
 
 
180 aa  150  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  48.73 
 
 
185 aa  149  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 
189 aa  147  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  47.65 
 
 
169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  48.32 
 
 
187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  43.79 
 
 
167 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  45.8 
 
 
248 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  38.22 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  38.92 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  41.22 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  42.67 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  38.85 
 
 
161 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  45.8 
 
 
176 aa  111  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1397  thioesterase superfamily protein  38.65 
 
 
172 aa  111  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  41.01 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  41.89 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  40.13 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.25 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  40.56 
 
 
158 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  40.65 
 
 
170 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  43.31 
 
 
168 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.1 
 
 
159 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
158 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 
158 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  43.7 
 
 
168 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  43.55 
 
 
175 aa  103  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
173 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  39.71 
 
 
149 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  45.05 
 
 
168 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.86 
 
 
159 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  45.08 
 
 
170 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 
149 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 
147 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  45.08 
 
 
170 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  39.04 
 
 
161 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  45.08 
 
 
170 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  45.95 
 
 
170 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0936  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 
172 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  45.95 
 
 
170 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  40.67 
 
 
159 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 
170 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 
159 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 
159 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  39.6 
 
 
169 aa  101  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  40.41 
 
 
159 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  40.41 
 
 
159 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  40.41 
 
 
159 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  40.41 
 
 
159 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  45.05 
 
 
187 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  45.05 
 
 
168 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  45.05 
 
 
168 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  45.05 
 
 
168 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  37.58 
 
 
163 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  45.05 
 
 
168 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  45.05 
 
 
168 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>