More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2647 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2647  PfkB  100 
 
 
322 aa  619  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  50.95 
 
 
313 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  47.78 
 
 
313 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  50.82 
 
 
308 aa  245  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  44.59 
 
 
323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  50 
 
 
315 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  43.59 
 
 
317 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  49.66 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  46.08 
 
 
315 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  47.15 
 
 
306 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  43.77 
 
 
324 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  49.35 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  46.2 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  45.45 
 
 
315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  41.48 
 
 
313 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  43.35 
 
 
325 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  46.88 
 
 
315 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  43.32 
 
 
312 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  40.26 
 
 
312 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  40.26 
 
 
312 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  40.51 
 
 
312 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  42.5 
 
 
312 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  203  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  42.14 
 
 
312 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  41.77 
 
 
313 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  42.24 
 
 
312 aa  202  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  202  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  42.5 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  40.74 
 
 
318 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  40 
 
 
330 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  31.65 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  39.53 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  33.01 
 
 
315 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  39.53 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
311 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  40.69 
 
 
315 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  40.25 
 
 
318 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  36.16 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  42.03 
 
 
327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  41.99 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  39.71 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  34.86 
 
 
308 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  40.2 
 
 
317 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  41.45 
 
 
328 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  41.45 
 
 
328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  40.51 
 
 
328 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  41.22 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  36.45 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  33.71 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  38.13 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  31.07 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  30.13 
 
 
310 aa  146  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  28.21 
 
 
311 aa  145  6e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  38.49 
 
 
325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  33.21 
 
 
303 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
303 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  32.2 
 
 
303 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
303 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  34.08 
 
 
315 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  42.47 
 
 
349 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
303 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  39.18 
 
 
318 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
303 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
303 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  32.95 
 
 
303 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  41.89 
 
 
325 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  32.8 
 
 
303 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.7 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4251  ribokinase-like domain-containing protein  40.96 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.598338  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  32.58 
 
 
303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  29.58 
 
 
306 aa  140  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  33.21 
 
 
311 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  30.28 
 
 
316 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  34.09 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  29.75 
 
 
302 aa  135  9e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  40.13 
 
 
321 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  33.71 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  28.67 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  35.74 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  30.45 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  30.45 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  31.09 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  30.36 
 
 
307 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  34.71 
 
 
310 aa  134  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  41.57 
 
 
333 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  31.11 
 
 
324 aa  133  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  38.68 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>