More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2560 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  100 
 
 		 268 aa  539  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  43.2 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  44.84 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  43.9 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  44.44 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  45.12 
 
 		 249 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  44.08 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  43.9 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  40 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  39.69 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  38.43 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.85 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  39.85 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  39.85 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  39.85 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  39.85 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  39.85 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  44.31 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  39.85 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  39.85 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  39.46 
 
 		 261 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  43.9 
 
 		 249 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  43.9 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  38.98 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  38.91 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  38.04 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  40.7 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  37.4 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  42.53 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  38.91 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  38.91 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  38.91 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  36.86 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  38.91 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  38.91 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  37.84 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  37.84 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  37.84 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  38.37 
 
 		 258 aa  165  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  37.45 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  37.45 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  38.34 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  38.52 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  36.84 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  35.57 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  36.64 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  32.68 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  34.14 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  34.51 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  34.51 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  36.08 
 
 		 247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  34.14 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  36.15 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  34.46 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  33.71 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  41.85 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  36.36 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  32.68 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.84 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  33.04 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.35 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  32.58 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.05 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.25 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.75 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.75 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.47 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.2 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  30.5 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.22 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  40 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.47 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.38 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.14 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.17 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.9 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.27 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  31.93 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  38.26 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  30.18 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  29.8 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.09 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.44 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.7 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.58 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.51 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>