More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2487 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  100 
 
 
307 aa  624  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4452  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  51.16 
 
 
312 aa  321  8e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4586  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  51.16 
 
 
312 aa  321  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.546959  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_003296  RS05369  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  50.17 
 
 
311 aa  318  6e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288036  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0185  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  51.72 
 
 
336 aa  312  4e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4736  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  49.31 
 
 
304 aa  311  8e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3408  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  48.66 
 
 
304 aa  309  3e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.996701 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1802  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  51.38 
 
 
305 aa  306  2e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0287622  hitchhiker  0.00208874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  48.66 
 
 
313 aa  306  2e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3049  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.99 
 
 
304 aa  305  4e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.62883  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4951  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.99 
 
 
304 aa  305  4e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551688  normal  0.0100534 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5317  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.99 
 
 
304 aa  305  4e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3688  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.93 
 
 
304 aa  305  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3393  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  50.85 
 
 
301 aa  305  8e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3655  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  50.85 
 
 
301 aa  305  8e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4864  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  50.34 
 
 
305 aa  304  1e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556224  normal  0.0460344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4103  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  48.83 
 
 
305 aa  304  1e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0332  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.65 
 
 
304 aa  303  2e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4676  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.99 
 
 
304 aa  303  2e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3371  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  51.56 
 
 
301 aa  303  2e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5204  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.99 
 
 
304 aa  303  2e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484805  normal  0.145003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1875  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  52.07 
 
 
307 aa  303  3e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207996  normal  0.131652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1689  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  52.07 
 
 
308 aa  302  4e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448176  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1215  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  48.66 
 
 
303 aa  301  6e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6531  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.83 
 
 
305 aa  301  6e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0827  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  49.83 
 
 
303 aa  300  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0328842  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05220  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  46.82 
 
 
303 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2814  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.16 
 
 
303 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5701  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  51.38 
 
 
301 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0251  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  48.62 
 
 
303 aa  295  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3599  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.16 
 
 
303 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815897  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2317  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  46.82 
 
 
303 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612252  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3098  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  46.82 
 
 
303 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2587  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  48.28 
 
 
303 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233222  hitchhiker  0.00609542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1947  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  48.96 
 
 
301 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4227  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  46.15 
 
 
303 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4549  dihydrodipicolinate synthetase family protein  46.15 
 
 
303 aa  288  5e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.301477  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5081  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  50.66 
 
 
301 aa  289  5e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1729  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  46.98 
 
 
303 aa  285  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  9.52381e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1993  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  46.9 
 
 
303 aa  283  2e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0280124  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1793  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  46.9 
 
 
303 aa  283  2e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2499  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  51.93 
 
 
304 aa  283  3e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3419  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.93 
 
 
328 aa  281  8e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269003  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1117  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  46.82 
 
 
303 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0351  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  50.17 
 
 
304 aa  275  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5345  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.92 
 
 
301 aa  274  1e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1596  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  46.37 
 
 
303 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2392  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.33 
 
 
304 aa  271  8e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.088042  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0037  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  48.17 
 
 
304 aa  268  6e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5150  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.57 
 
 
304 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1030  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  48.1 
 
 
313 aa  248  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113729  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5157  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  43.96 
 
 
321 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414541  hitchhiker  0.0087046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4039  dihydrodipicolinate synthetase  44.64 
 
 
321 aa  235  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2020  dihydrodipicolinate synthetase  44.33 
 
 
301 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874189  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4201  dihydrodipicolinate synthetase  43.49 
 
 
308 aa  232  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0755  dihydrodipicolinate synthetase  43.88 
 
 
311 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  45.52 
 
 
330 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1084  dihydrodipicolinate synthetase  44.86 
 
 
301 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00262766  hitchhiker  0.00208818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1718  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  45.7 
 
 
301 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7513  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  42.76 
 
 
326 aa  214  1e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3337  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  39.06 
 
 
301 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0788  dihydrodipicolinate synthetase  43.24 
 
 
306 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.049848 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3137  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  39.19 
 
 
300 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.321867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1498  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  42.21 
 
 
291 aa  167  3e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.37 
 
 
308 aa  115  1e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  29.89 
 
 
292 aa  114  2e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.79 
 
 
301 aa  111  1e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  25.8 
 
 
313 aa  112  1e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 
290 aa  110  4e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.6647e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  28.21 
 
 
292 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.31213e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0196  dihydrodipicolinate synthetase  30.53 
 
 
307 aa  108  8e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1237  dihydrodipicolinate synthetase  43.14 
 
 
199 aa  108  9e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  27.65 
 
 
294 aa  108  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  36.07 
 
 
292 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  36.07 
 
 
292 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4436  dihydrodipicolinate synthetase  29.46 
 
 
311 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0722382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 
291 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  33.05 
 
 
292 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 
292 aa  105  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  29.91 
 
 
292 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  6.0181e-05  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  29.39 
 
 
296 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  28.11 
 
 
291 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 
290 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4210  dihydrodipicolinate synthetase  26.21 
 
 
319 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 
293 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 
293 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 
298 aa  102  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  29.58 
 
 
292 aa  102  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 
300 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 
298 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 
293 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5532  dihydrodipicolinate synthetase  28.23 
 
 
301 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  24.05 
 
 
298 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 
292 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 
292 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 
292 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.02013e-05  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 
292 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.42983e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 
292 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 
292 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 
292 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.21965e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>