More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2422 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  58.95 
 
 		 241 aa  271  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  61.36 
 
 		 232 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  61.97 
 
 		 239 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  58.26 
 
 		 234 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  61.21 
 
 		 240 aa  268  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  59.53 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  58.77 
 
 		 240 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  58.77 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  55.83 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  54.85 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  54.85 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  50.88 
 
 		 239 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  52.43 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 238 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 258 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 220 aa  198  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 222 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 220 aa  195  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 226 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03369  Transcriptional regulator, GntR family protein  48.56 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  47.09 
 
 		 214 aa  185  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  47.09 
 
 		 218 aa  184  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  43.27 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  40.69 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 218 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  38.5 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  40.43 
 
 		 215 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 218 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 245 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 275 aa  98.6  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  36.59 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>