More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2403 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  100 
 
 		 475 aa  933    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  47.16 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  43.96 
 
 		 458 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  47.21 
 
 		 457 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  43.07 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  44.07 
 
 		 477 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  44.07 
 
 		 477 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  44.25 
 
 		 457 aa  349  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  44.25 
 
 		 457 aa  348  8e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  44.25 
 
 		 457 aa  348  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  41.72 
 
 		 460 aa  347  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  43.26 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  43.78 
 
 		 453 aa  343  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  42.27 
 
 		 461 aa  342  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  41.99 
 
 		 456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  42.95 
 
 		 459 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  42.86 
 
 		 459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  41.9 
 
 		 459 aa  336  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  42.86 
 
 		 459 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  41.34 
 
 		 452 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  43.2 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  41.29 
 
 		 456 aa  334  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  42.64 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  42.21 
 
 		 459 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  41.99 
 
 		 459 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  41.99 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  42.98 
 
 		 457 aa  330  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  42.98 
 
 		 457 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  42.98 
 
 		 457 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  42.98 
 
 		 457 aa  329  6e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  42.98 
 
 		 457 aa  329  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  41.77 
 
 		 459 aa  329  7e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  42.98 
 
 		 457 aa  329  8e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  42.98 
 
 		 457 aa  329  8e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  42.98 
 
 		 457 aa  328  9e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  42.98 
 
 		 457 aa  328  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  41.96 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  39.96 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  43.29 
 
 		 478 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  41.59 
 
 		 458 aa  324  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  41.81 
 
 		 453 aa  323  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  47.36 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  42.23 
 
 		 457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  42.23 
 
 		 457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  41.14 
 
 		 457 aa  319  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  42.23 
 
 		 457 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  42.23 
 
 		 457 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  41.67 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  40.92 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  42.23 
 
 		 457 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  40.44 
 
 		 464 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  40.79 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  41.39 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  40.04 
 
 		 461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  38.21 
 
 		 455 aa  306  6e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  38.46 
 
 		 455 aa  306  6e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  37.17 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  40.13 
 
 		 480 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  38.19 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  34.62 
 
 		 453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  34.63 
 
 		 453 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  34.42 
 
 		 453 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  34.42 
 
 		 453 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  34.71 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  37.02 
 
 		 456 aa  280  5e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  37.34 
 
 		 454 aa  280  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  34.92 
 
 		 452 aa  279  9e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  34.13 
 
 		 452 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  33.98 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  34.06 
 
 		 452 aa  276  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  34.42 
 
 		 455 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  33.84 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  34.49 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3309  MATE efflux family protein  38.95 
 
 		 479 aa  261  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2429  multidrug efflux protein  38.48 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  38.07 
 
 		 441 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  35.9 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000288761  decreased coverage  0.0000000485587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  32.96 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2909  multidrug efflux protein  33.63 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144905  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3585  MATE efflux family protein  36.95 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  34.51 
 
 		 450 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  37.33 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1180  inner membrane transmembrane protein  34.53 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000781542  normal  0.19952 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  33.48 
 
 		 453 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1115  MATE efflux family protein  33.76 
 
 		 448 aa  213  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000487521  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  33.69 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  33.69 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  31.98 
 
 		 459 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2146  multidrug efflux protein  35.19 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  32.76 
 
 		 451 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1023  MATE efflux family protein  33.25 
 
 		 448 aa  210  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00302987  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2236  multidrug efflux protein  34.72 
 
 		 453 aa  208  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1313  Na+-driven multidrug efflux pump  30.8 
 
 		 449 aa  206  5e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0190769  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  29.34 
 
 		 457 aa  203  6e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  32.19 
 
 		 459 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1859  MATE efflux family protein  33.69 
 
 		 450 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763838  normal  0.0423968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2139  MATE efflux family protein  32.6 
 
 		 449 aa  196  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000263742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3365  multi anti extrusion protein MatE  32.89 
 
 		 452 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  31.66 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1224  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000144559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>