More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2398 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  58.27 
 
 
639 aa  645  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  57.16 
 
 
631 aa  643  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  56.36 
 
 
642 aa  659  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  58.05 
 
 
636 aa  660  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  56.66 
 
 
642 aa  660  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  56.88 
 
 
642 aa  678  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  54.14 
 
 
640 aa  680  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  57.06 
 
 
640 aa  653  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  57.89 
 
 
636 aa  658  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 
637 aa  644  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.14394e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  58.02 
 
 
641 aa  648  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  100 
 
 
650 aa  1298  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  52.07 
 
 
638 aa  637  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  56.36 
 
 
642 aa  659  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  52.46 
 
 
645 aa  632  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2140  ABC transporter ATP-binding protein  58.36 
 
 
640 aa  631  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25020  ABC transporter ATP-binding protein  58.51 
 
 
640 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  52.81 
 
 
641 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  54.06 
 
 
663 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  53.45 
 
 
636 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  51.53 
 
 
640 aa  624  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  51.99 
 
 
645 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  52.58 
 
 
642 aa  623  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  51.67 
 
 
641 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
648 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
648 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
648 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 
660 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  50 
 
 
637 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 
660 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  52.21 
 
 
649 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  52.66 
 
 
649 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
660 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  52.29 
 
 
661 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
1065 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  50.15 
 
 
637 aa  616  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  50 
 
 
637 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  52.29 
 
 
661 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  52.75 
 
 
648 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  53.81 
 
 
636 aa  612  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  51.53 
 
 
649 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  51.53 
 
 
648 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  49.01 
 
 
640 aa  605  1e-172  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  51.53 
 
 
649 aa  606  1e-172  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  54 
 
 
648 aa  605  1e-172  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  49.31 
 
 
641 aa  602  1e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  48.85 
 
 
640 aa  602  1e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  49.31 
 
 
641 aa  602  1e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  55.37 
 
 
632 aa  603  1e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
646 aa  603  1e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  49.31 
 
 
641 aa  602  1e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  48.7 
 
 
640 aa  602  1e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  49.31 
 
 
641 aa  603  1e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  51.6 
 
 
639 aa  598  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  47.69 
 
 
645 aa  600  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  49.24 
 
 
641 aa  598  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  53.34 
 
 
615 aa  600  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  50.15 
 
 
642 aa  599  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  49.92 
 
 
626 aa  596  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  51.61 
 
 
639 aa  595  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.85056e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  50.46 
 
 
639 aa  595  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  48.55 
 
 
640 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2468  ABC transporter ATPase component  49.31 
 
 
640 aa  598  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.65711e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  51.99 
 
 
636 aa  595  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  48.24 
 
 
647 aa  597  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  49.46 
 
 
645 aa  596  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  50.46 
 
 
639 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  49.24 
 
 
639 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  51.54 
 
 
623 aa  592  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  48.77 
 
 
632 aa  592  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  48.39 
 
 
638 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  49.92 
 
 
649 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  51.83 
 
 
688 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  50.08 
 
 
638 aa  591  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  51.55 
 
 
627 aa  587  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 
632 aa  584  1e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  53.56 
 
 
639 aa  583  1e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  48.17 
 
 
638 aa  579  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  53.54 
 
 
637 aa  579  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  52.84 
 
 
633 aa  582  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  50.15 
 
 
635 aa  581  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17313e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  48.93 
 
 
634 aa  582  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  4.34555e-05 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  48.7 
 
 
635 aa  581  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  52.22 
 
 
644 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  48.43 
 
 
653 aa  581  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  51.91 
 
 
643 aa  580  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  53.03 
 
 
626 aa  577  1e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2095  ABC transporter related  52.94 
 
 
623 aa  577  1e-163  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.958097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  48.39 
 
 
635 aa  573  1e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.10719e-06  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  50.08 
 
 
641 aa  572  1e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.59167e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  49.61 
 
 
629 aa  569  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  48.71 
 
 
635 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  48.71 
 
 
635 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  48.71 
 
 
635 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  48.71 
 
 
635 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  47.96 
 
 
648 aa  570  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  47.81 
 
 
648 aa  569  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  48.55 
 
 
635 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  49 
 
 
635 aa  566  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  49.23 
 
 
629 aa  568  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>