More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2397 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  306  9e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  55.4 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  55.03 
 
 
149 aa  166  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  56.34 
 
 
145 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  55.63 
 
 
145 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  54.23 
 
 
149 aa  152  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  52.82 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  51.41 
 
 
146 aa  150  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  51.75 
 
 
146 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  51.41 
 
 
146 aa  139  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  50.35 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  50.7 
 
 
146 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  53.52 
 
 
145 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  50.7 
 
 
146 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  50 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  44.16 
 
 
166 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  44.14 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  41.01 
 
 
143 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  41.01 
 
 
143 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  45.52 
 
 
146 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  45.52 
 
 
146 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  39.72 
 
 
144 aa  103  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  39.57 
 
 
144 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  35.17 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1843  universal stress protein  33.11 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.120416  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.97 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2130  hypothetical protein  32.43 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.42 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2171  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  32.43 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  32.43 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  32.43 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  32.43 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  30.46 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  32.43 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  32.43 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  32.43 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  32.43 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 
162 aa  72  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  31.76 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  31.65 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  31.65 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.87 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  33.11 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  32.43 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  30.19 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  31.47 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.26 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  31.79 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  35.14 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  32.43 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  35.14 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  30.97 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  36.62 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  30.92 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  30.92 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  31.29 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02048  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  50.72 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00697742  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.03 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  31.21 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.57 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.61 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.61 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.72 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
175 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  31.97 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.26 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.67 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  33.11 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  33.11 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  30.61 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  29.37 
 
 
283 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.71 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  32.85 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  29.05 
 
 
310 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  31.21 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  34.48 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  26.67 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.57 
 
 
149 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.33 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  33.77 
 
 
169 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  32.41 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30.2 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
167 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>