More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2395 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  100 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  47.92 
 
 		 144 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  47.92 
 
 		 144 aa  145  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  47.92 
 
 		 144 aa  145  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  47.92 
 
 		 144 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  47.92 
 
 		 144 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  47.92 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  47.92 
 
 		 144 aa  145  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  48.57 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  47.22 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  50 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  49.26 
 
 		 145 aa  139  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  47.48 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  47.48 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  47.48 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  47.48 
 
 		 146 aa  136  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  47.48 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  47.48 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  47.79 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  44.76 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  44.76 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  44.76 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  47.79 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  45.83 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  44.06 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  47.9 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  47.06 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 145 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  43.85 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 168 aa  103  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  42.64 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  40.65 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  43.22 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  37.69 
 
 		 161 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  42.65 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  37.86 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 154 aa  84.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 176 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  45.56 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  35.71 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  30.94 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  35.58 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>