44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2244 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  635    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  85.44 
 
 
309 aa  543  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  30.51 
 
 
376 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  28.08 
 
 
375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0471798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  29.07 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  29.15 
 
 
385 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  26.95 
 
 
373 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  26.3 
 
 
317 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3864  hypothetical protein  30.52 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01955  hypothetical protein  26.17 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.409206  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  34.4 
 
 
247 aa  62.4  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  23.75 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  24.56 
 
 
358 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  34.86 
 
 
235 aa  59.3  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  23.59 
 
 
379 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  29.65 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  35.05 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  37.11 
 
 
220 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  27.32 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  35.05 
 
 
259 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  31.67 
 
 
360 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  26.09 
 
 
376 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  23.53 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7605  hypothetical protein  31.67 
 
 
360 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  25.45 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7019  hypothetical protein  28.38 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280958  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3482  hypothetical protein  24.66 
 
 
309 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  22.75 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  22.77 
 
 
376 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2277  hypothetical protein  24.43 
 
 
357 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  21.82 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3919  hypothetical protein  23.47 
 
 
262 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.961515  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3917  hypothetical protein  26.84 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.861601  normal  0.472935 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2493  hypothetical protein  24.69 
 
 
273 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3619  hypothetical protein  23.71 
 
 
305 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0881577  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2279  hypothetical protein  24.88 
 
 
358 aa  49.3  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0760878  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3852  hypothetical protein  28.43 
 
 
306 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527403  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0841  hypothetical protein  25.59 
 
 
338 aa  46.2  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2593  hypothetical protein  23.02 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3853  hypothetical protein  28.43 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3114  hypothetical protein  25.34 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0038  hypothetical protein  26.07 
 
 
338 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2114  hypothetical protein  21.54 
 
 
292 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  23.91 
 
 
308 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>