More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2179 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  635    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  50.81 
 
 
321 aa  298  7e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  50 
 
 
317 aa  272  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  47.92 
 
 
313 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  46.15 
 
 
314 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  46.79 
 
 
314 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  48.08 
 
 
316 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  46.79 
 
 
313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  47.44 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  46.15 
 
 
314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  45.83 
 
 
314 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  45.83 
 
 
314 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  44.75 
 
 
306 aa  248  7e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  46.47 
 
 
315 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  45.83 
 
 
315 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  44.81 
 
 
322 aa  235  9e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  42.16 
 
 
316 aa  232  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  44.59 
 
 
302 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  44.34 
 
 
310 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  42.72 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  43.17 
 
 
329 aa  208  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  40.8 
 
 
317 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  38.91 
 
 
319 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  39.23 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  41.27 
 
 
316 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  40.19 
 
 
320 aa  192  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  40.51 
 
 
320 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  40.59 
 
 
312 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  38.17 
 
 
314 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  36.63 
 
 
315 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  41.36 
 
 
212 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.15 
 
 
199 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  43.01 
 
 
198 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  48.03 
 
 
134 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  46.07 
 
 
194 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  46.83 
 
 
129 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  45.31 
 
 
131 aa  123  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  48.8 
 
 
127 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  45.16 
 
 
130 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  45.31 
 
 
129 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  44.53 
 
 
130 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  44.53 
 
 
132 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  46.72 
 
 
129 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  43.75 
 
 
130 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  43.75 
 
 
130 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  43.75 
 
 
132 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  43.75 
 
 
132 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  44.88 
 
 
134 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  43.75 
 
 
130 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  30.99 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  30.99 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  44.85 
 
 
196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  41.41 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  45.24 
 
 
133 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  41.97 
 
 
194 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  42.49 
 
 
194 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  47.24 
 
 
134 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0240  mutator mutT protein  42.28 
 
 
137 aa  112  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611039  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1957  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  42.28 
 
 
137 aa  112  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.892636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  46.46 
 
 
134 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  47.5 
 
 
128 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  47.06 
 
 
194 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  47.06 
 
 
194 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  47.06 
 
 
194 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  45.6 
 
 
142 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45.24 
 
 
135 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
360 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  45.6 
 
 
137 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  44.8 
 
 
131 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  42.29 
 
 
209 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  42.29 
 
 
209 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  42.29 
 
 
209 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  42.29 
 
 
209 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  43.01 
 
 
196 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  43.01 
 
 
196 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  40.16 
 
 
132 aa  106  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  43.8 
 
 
386 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  42.29 
 
 
209 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  41.88 
 
 
194 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  41.91 
 
 
144 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  45.83 
 
 
137 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  42.4 
 
 
138 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  45.16 
 
 
132 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  42.4 
 
 
138 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  45.08 
 
 
334 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  41.6 
 
 
138 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  44.63 
 
 
347 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1686  NUDIX hydrolase  27.25 
 
 
360 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.873349  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.65 
 
 
134 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  40.16 
 
 
132 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  45.08 
 
 
135 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1604  NUDIX hydrolase  28.14 
 
 
369 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  42.06 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 
128 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  43.2 
 
 
136 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 
128 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 
128 aa  98.2  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  41.73 
 
 
134 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  43.55 
 
 
132 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>