More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2159 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2159  chaperonin Cpn10  100 
 
 
96 aa  186  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.692492  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03919  co-chaperonin GroES  73.96 
 
 
96 aa  149  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04012  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3850  chaperonin Cpn10  76.04 
 
 
97 aa  147  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03974  hypothetical protein  76.04 
 
 
97 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4383  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  147  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5658  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  147  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.308245 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4611  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  147  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.325354 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3870  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  147  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.819569 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4671  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  147  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4697  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0723  co-chaperonin GroES  75 
 
 
97 aa  145  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0956  co-chaperonin GroES  75 
 
 
96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377346  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3823  co-chaperonin GroES  75 
 
 
97 aa  145  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3676  co-chaperonin GroES  75 
 
 
97 aa  145  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3530  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.437614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3404  co-chaperonin GroES  75 
 
 
97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4309  co-chaperonin GroES  74.47 
 
 
96 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0471  co-chaperonin GroES  72.92 
 
 
96 aa  144  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.695304  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0421  co-chaperonin GroES  72.34 
 
 
96 aa  143  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118204  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0727  co-chaperonin GroES  75 
 
 
97 aa  144  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.816729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0508  co-chaperonin GroES  75 
 
 
97 aa  144  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0981396  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0703  co-chaperonin GroES  72.34 
 
 
96 aa  143  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3398  co-chaperonin GroES  72.34 
 
 
96 aa  143  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.249246  decreased coverage  0.000697268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0554  co-chaperonin GroES  72.34 
 
 
96 aa  143  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.109062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3568  co-chaperonin GroES  72.34 
 
 
96 aa  143  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00627875  decreased coverage  0.00976024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3125  co-chaperonin GroES  71.88 
 
 
96 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0218784  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0641  co-chaperonin GroES  73.4 
 
 
96 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.409973  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3709  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 
96 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.771155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0644  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 
96 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0667  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 
96 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0700  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 
96 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000383643  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0671  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 
96 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139868  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0843  chaperonin Cpn10, GroES, small subunit of GroESL  71.88 
 
 
96 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.200224  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0329  co-chaperonin GroES  71.88 
 
 
97 aa  140  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000330664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3690  co-chaperonin GroES  72.34 
 
 
96 aa  140  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2494  chaperonin Cpn10, GroES, small subunit of GroESL  70.83 
 
 
96 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0174114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3661  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 
96 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000131471  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4690  co-chaperonin GroES  70.83 
 
 
97 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4599  co-chaperonin GroES  70.83 
 
 
97 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4726  co-chaperonin GroES  70.83 
 
 
97 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4747  co-chaperonin GroES  70.83 
 
 
97 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  normal  0.604032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0408  co-chaperonin GroES  71.88 
 
 
97 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4607  co-chaperonin GroES  70.83 
 
 
97 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0592  co-chaperonin GroES  70.83 
 
 
97 aa  138  3e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3752  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 
96 aa  137  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.872968  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0467  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 
96 aa  137  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000130489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00143  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 
96 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002224  heat shock protein 60 family co-chaperone GroES  69.79 
 
 
96 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  71.88 
 
 
95 aa  134  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2238  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 
96 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 
96 aa  133  7.000000000000001e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 
97 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 
97 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0018  10 kDa chaperonin 1  68.75 
 
 
95 aa  130  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0883  Bvg accessory factor  66.67 
 
 
96 aa  130  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200777  hitchhiker  0.000120487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 
97 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 
97 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  66.67 
 
 
97 aa  129  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
97 aa  129  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
97 aa  129  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4502  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125331  hitchhiker  0.00150559 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 
96 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 
96 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
96 aa  122  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 
96 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
96 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  63.54 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 
96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 
96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 
95 aa  117  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  63.54 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  62.5 
 
 
96 aa  114  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 
96 aa  114  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
97 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
104 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 
95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 
97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 
95 aa  110  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
96 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 
96 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  59.38 
 
 
96 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000723  heat shock protein 60 family co-chaperone GroES  56.25 
 
 
96 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  55.21 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  55.21 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>