274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2039 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  63.8 
 
 
218 aa  280  9e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  59.72 
 
 
218 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  58.9 
 
 
216 aa  277  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  63.38 
 
 
211 aa  274  9e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  62.62 
 
 
210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  64.32 
 
 
210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  64.79 
 
 
210 aa  270  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  64.32 
 
 
211 aa  270  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  62.44 
 
 
210 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  62.44 
 
 
210 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  59.15 
 
 
210 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  58.69 
 
 
210 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  58.69 
 
 
210 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  59.15 
 
 
210 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  58.69 
 
 
210 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  61.03 
 
 
210 aa  260  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1410  radical SAM domain protein  64.32 
 
 
211 aa  260  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  58.22 
 
 
210 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  59.15 
 
 
210 aa  259  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  58.69 
 
 
210 aa  258  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  63.72 
 
 
212 aa  257  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  63.26 
 
 
212 aa  256  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3190  hypothetical protein  62.04 
 
 
211 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241224  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  64.32 
 
 
210 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  57.75 
 
 
210 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  60.09 
 
 
210 aa  256  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1161  Radical SAM domain protein  64.32 
 
 
210 aa  255  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  63.38 
 
 
210 aa  254  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  57.28 
 
 
210 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  57.28 
 
 
210 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  57.28 
 
 
210 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  57.28 
 
 
210 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  59.62 
 
 
212 aa  254  8e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  57.28 
 
 
210 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  57.28 
 
 
210 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  59.81 
 
 
212 aa  254  9e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  57.28 
 
 
210 aa  254  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  62.44 
 
 
210 aa  254  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  59.15 
 
 
212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  59.62 
 
 
211 aa  251  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  61.5 
 
 
210 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  56.34 
 
 
210 aa  249  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  57.75 
 
 
211 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  55.4 
 
 
210 aa  248  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  60.09 
 
 
212 aa  248  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  62.33 
 
 
211 aa  248  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  57.75 
 
 
211 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  59.26 
 
 
209 aa  246  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  56.81 
 
 
211 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  62.44 
 
 
209 aa  246  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  54.93 
 
 
210 aa  245  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  54.34 
 
 
217 aa  241  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  57.28 
 
 
211 aa  241  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  56.54 
 
 
210 aa  241  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  58.41 
 
 
211 aa  241  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1115  radical SAM domain-containing protein  61.03 
 
 
209 aa  239  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0597  hypothetical protein  56.34 
 
 
216 aa  237  9e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4381  hypothetical protein  55.7 
 
 
237 aa  236  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  55.61 
 
 
210 aa  236  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  57.6 
 
 
212 aa  234  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  55.61 
 
 
212 aa  231  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  54.38 
 
 
212 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  57.47 
 
 
224 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6594  radical SAM domain-containing protein  62.44 
 
 
210 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  59.02 
 
 
198 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1081  hypothetical protein  59.81 
 
 
222 aa  214  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  41.15 
 
 
233 aa  135  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  38.5 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  30.97 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  34.55 
 
 
216 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 
192 aa  89  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  32.14 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  30.59 
 
 
205 aa  85.9  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  31.25 
 
 
193 aa  85.1  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  30.32 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  31.96 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  28 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  36.3 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  32.74 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  25.21 
 
 
226 aa  78.2  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  32.23 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  32.14 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  32.29 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  30.04 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  37.04 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  31.82 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  36.17 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  27.48 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  27.48 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  29.08 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  28.51 
 
 
246 aa  72  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>