15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1796 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1796  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  304  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0642  hypothetical protein  33.57 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19350  hypothetical protein  41.94 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.545788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4729  hypothetical protein  29.94 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1415  hypothetical protein  31.78 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303637  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3910  hypothetical protein  29.94 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.518185  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4115  hypothetical protein  29.94 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4002  hypothetical protein  29.94 
 
 
155 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3948  hypothetical protein  27.33 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4824  hypothetical protein  25.52 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0471  hypothetical protein  27.68 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0054  hypothetical protein  26.92 
 
 
155 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  normal  0.044221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0088  hypothetical protein  27.5 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000738017  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00011  hypothetical protein  32.31 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0011  hypothetical protein  28.17 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>