More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1658 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 483 aa  951    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  45.77 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  46.27 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  48.01 
 
 		 428 aa  319  7e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  47.21 
 
 		 408 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  47.16 
 
 		 416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  44.07 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  44.72 
 
 		 419 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  42.18 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  40.24 
 
 		 457 aa  266  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  39.87 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  42.56 
 
 		 441 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  42.46 
 
 		 432 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  42.46 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  42.46 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  42.46 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  42.46 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  42.46 
 
 		 432 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  42.46 
 
 		 432 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  40.38 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  40.38 
 
 		 443 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  40.38 
 
 		 443 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  40.38 
 
 		 443 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  40.96 
 
 		 454 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  40.72 
 
 		 468 aa  256  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  39.7 
 
 		 454 aa  253  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  39.7 
 
 		 454 aa  253  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  41.5 
 
 		 443 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  37.74 
 
 		 461 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  38.56 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  38.07 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  36.13 
 
 		 484 aa  238  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  38.13 
 
 		 478 aa  237  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  38.13 
 
 		 478 aa  237  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  37.35 
 
 		 469 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  36.08 
 
 		 492 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  36.47 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  34.98 
 
 		 482 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  38.28 
 
 		 452 aa  206  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  33.26 
 
 		 482 aa  206  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  32.39 
 
 		 493 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  34.14 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  30.43 
 
 		 477 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  32.33 
 
 		 493 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  32.81 
 
 		 490 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  32.94 
 
 		 460 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  33.33 
 
 		 492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  34.11 
 
 		 482 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  34.11 
 
 		 482 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  34.11 
 
 		 482 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  34.11 
 
 		 482 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  34.11 
 
 		 482 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  34.11 
 
 		 482 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  33.67 
 
 		 496 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  33.17 
 
 		 460 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  39.86 
 
 		 473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  32.99 
 
 		 466 aa  173  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  31.12 
 
 		 464 aa  172  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  33.17 
 
 		 461 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  34.36 
 
 		 520 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  40.96 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  33.01 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  32.73 
 
 		 517 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  30.97 
 
 		 514 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  32.2 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  30.66 
 
 		 526 aa  170  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  33.81 
 
 		 679 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0645  type II and III secretion system protein  31.59 
 
 		 436 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  34.97 
 
 		 539 aa  166  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  31.7 
 
 		 486 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  33.52 
 
 		 571 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  31.08 
 
 		 633 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  32.23 
 
 		 690 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  39.22 
 
 		 474 aa  163  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  32.23 
 
 		 690 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  45.36 
 
 		 507 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  31.52 
 
 		 620 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  31.92 
 
 		 690 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  31.65 
 
 		 652 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  32.93 
 
 		 491 aa  161  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  28.37 
 
 		 436 aa  161  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  33.08 
 
 		 474 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  31.86 
 
 		 530 aa  159  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  31.6 
 
 		 479 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  29.05 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  29.05 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  30.95 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  38.29 
 
 		 491 aa  159  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  30.88 
 
 		 646 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  30.88 
 
 		 642 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  30.88 
 
 		 642 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  37.94 
 
 		 463 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  30.94 
 
 		 656 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  34.48 
 
 		 622 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  30.03 
 
 		 423 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  30.12 
 
 		 386 aa  156  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  30.38 
 
 		 657 aa  156  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  29.11 
 
 		 483 aa  156  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>