More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1613 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1613  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 
250 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44944  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  79.12 
 
 
249 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  77.11 
 
 
249 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25860  electron transfer flavoprotein beta-subunit  76.71 
 
 
249 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.064795  normal  0.177804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2707  electron transfer flavoprotein beta-subunit  75.5 
 
 
249 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462646  normal  0.372016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  75.9 
 
 
249 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1995  electron transfer flavoprotein subunit beta  76.31 
 
 
249 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184939  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2174  electron transfer flavoprotein subunit beta  75.5 
 
 
249 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  75.5 
 
 
249 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4117  electron transfer flavoprotein subunit beta  75.9 
 
 
249 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.838389  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3526  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  74.7 
 
 
249 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14280  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  73.49 
 
 
256 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577888  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4202  electron transfer flavoprotein, beta subunit  73.9 
 
 
249 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1651  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  73.9 
 
 
249 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3774  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  73.49 
 
 
249 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3160  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.89 
 
 
249 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2146  electron transfer flavoprotein beta-subunit  71.89 
 
 
271 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0676192  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00996  electron transfer flavoprotein, beta subunit  72.8 
 
 
250 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.125142  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3687  electron transfer flavoprotein, beta subunit  70 
 
 
250 aa  363  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0614  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  69.88 
 
 
249 aa  352  4e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.347072  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0654  electron transfer flavoprotein beta-subunit  73.9 
 
 
249 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2584  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.08 
 
 
249 aa  351  7e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000331041  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  71.19 
 
 
249 aa  344  8e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3236  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  69.48 
 
 
249 aa  343  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.654108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  343  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16410  electron transfer flavoprotein beta subunit  70.68 
 
 
249 aa  340  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.272786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2855  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  69.08 
 
 
249 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0532  electron transport flavoprotein beta-subunit  69.48 
 
 
249 aa  340  2e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0527  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.48 
 
 
249 aa  339  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0240946  hitchhiker  0.00903597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2748  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1445  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.28 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0968162  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1352  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00189671  hitchhiker  0.00845091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1417  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000497046  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3015  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.47 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.437148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1169  electron transfer flavoprotein, beta subunit  66.67 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000191925  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2511  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.67 
 
 
249 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1405  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000200993  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000407  electron transfer flavoprotein beta subunit  65.6 
 
 
250 aa  334  9e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3145  electron transfer flavoprotein, beta subunit  67.47 
 
 
249 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  332  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000795792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3196  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  70.78 
 
 
249 aa  332  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.410827  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1998  ATPase  67.87 
 
 
249 aa  332  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00163986  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2995  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.47 
 
 
249 aa  331  8e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0119952  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1511  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.47 
 
 
249 aa  331  8e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178615  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2866  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.47 
 
 
249 aa  331  8e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000232207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  68.67 
 
 
249 aa  330  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2847  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000762035  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6309  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  328  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.87 
 
 
249 aa  328  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  68 
 
 
250 aa  328  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  327  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05548  electron transfer flavoprotein subunit beta  67.87 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.47 
 
 
249 aa  325  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.87 
 
 
249 aa  326  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  67.47 
 
 
249 aa  325  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.47 
 
 
249 aa  325  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.87 
 
 
249 aa  326  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  68.67 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.47 
 
 
249 aa  325  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  325  6e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  324  7e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  324  7e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  324  8.000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.87 
 
 
249 aa  323  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  322  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3854  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445723  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  322  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  319  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.6 
 
 
249 aa  319  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  319  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  318  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0217  electron transfer flavoprotein beta subunit  65.87 
 
 
252 aa  318  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  317  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9247  electron transfer flavoprotein beta subunit  66.67 
 
 
249 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0111601  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  65.46 
 
 
249 aa  316  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4915  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751979  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  64.66 
 
 
249 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  316  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  316  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  65.46 
 
 
249 aa  316  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0456  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.35 
 
 
250 aa  316  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3169  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.35 
 
 
250 aa  316  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  315  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  315  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  315  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3033  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  315  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  64.66 
 
 
249 aa  315  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>