More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1590 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
162 aa  326  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  56.05 
 
 
160 aa  174  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  54.78 
 
 
160 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  55.41 
 
 
160 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  54.14 
 
 
160 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  54.55 
 
 
160 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  54.55 
 
 
160 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  52.6 
 
 
154 aa  167  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  48.05 
 
 
163 aa  165  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  52.87 
 
 
162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  51.95 
 
 
159 aa  157  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
154 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  52.29 
 
 
159 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  49.03 
 
 
158 aa  154  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  50.32 
 
 
155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  51.3 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  51.02 
 
 
165 aa  154  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.44 
 
 
160 aa  153  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  48.37 
 
 
166 aa  151  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  48.05 
 
 
154 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  48.68 
 
 
161 aa  149  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  51.68 
 
 
182 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  48.05 
 
 
154 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  49.35 
 
 
154 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  52.83 
 
 
164 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  50.68 
 
 
165 aa  148  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 
162 aa  148  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  44.71 
 
 
175 aa  147  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  48.05 
 
 
154 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  48.05 
 
 
154 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  47.2 
 
 
165 aa  147  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  46 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  52.94 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  45.75 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  46.88 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  52.7 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  51.37 
 
 
157 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  52.6 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  48.05 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  48.61 
 
 
154 aa  144  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  43.23 
 
 
163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1422  protein tyrosine phosphatase  47.92 
 
 
154 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  45.03 
 
 
156 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  52.29 
 
 
164 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  52.29 
 
 
164 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  52.29 
 
 
159 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  52.29 
 
 
164 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  52.29 
 
 
159 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1047  protein tyrosine phosphatase  51.37 
 
 
154 aa  141  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  52.29 
 
 
164 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  52.29 
 
 
164 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  51.72 
 
 
157 aa  141  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  51.03 
 
 
159 aa  140  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  50.34 
 
 
175 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  51.03 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  42.68 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  46.26 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  47.06 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  46.98 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  48.28 
 
 
154 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.1 
 
 
164 aa  138  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  49.02 
 
 
158 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
163 aa  138  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.61 
 
 
154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  45.27 
 
 
149 aa  137  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  50.33 
 
 
159 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0815  protein tyrosine phosphatase  55.56 
 
 
161 aa  137  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265223  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  48 
 
 
174 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.22 
 
 
159 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  48.7 
 
 
158 aa  135  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.59 
 
 
161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  47.1 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  45.33 
 
 
162 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  49.66 
 
 
155 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  51.27 
 
 
160 aa  133  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  42.58 
 
 
160 aa  134  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2038  protein tyrosine phosphatase  52.24 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326657  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  44 
 
 
165 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  39.35 
 
 
154 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  40.91 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  47.52 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0851  protein tyrosine phosphatase  51.7 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  48.18 
 
 
166 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
188 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 
157 aa  130  9e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  43.54 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  46.1 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3326  protein tyrosine phosphatase  47.26 
 
 
157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4051  protein tyrosine phosphatase  47.26 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00946919  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.76 
 
 
157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17831  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.05 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.35 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  39.35 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.35 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  44.16 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.35 
 
 
154 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  44.9 
 
 
156 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.35 
 
 
154 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.35 
 
 
154 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>