202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1472 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1472  serine phosphatase  100 
 
 
379 aa  769    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  40.88 
 
 
394 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.15 
 
 
393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  37.34 
 
 
394 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
393 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  35.9 
 
 
393 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  37.08 
 
 
394 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.6 
 
 
412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1479  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
402 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  35.53 
 
 
394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  35.29 
 
 
412 aa  215  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  37.5 
 
 
394 aa  215  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  35.53 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 
399 aa  186  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.76 
 
 
566 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  28.29 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.28 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  27.57 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.27 
 
 
496 aa  77  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  28.16 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.85 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.24 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3196  response regulator  25.64 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.22 
 
 
486 aa  74.3  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.86 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  23.79 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.96 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1372  response regulator receiver protein  23.22 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0119088  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.84 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  24.06 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1467  response regulator receiver protein  24.26 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0140274  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1312  response regulator receiver protein  23.72 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000399806  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1379  response regulator receiver protein  23.72 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00673289  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2896  response regulator receiver protein  24.26 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00201335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2906  response regulator receiver protein  24.26 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0132666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.42 
 
 
672 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  25.59 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3038  response regulator receiver protein  24.62 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  27.76 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  25.68 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  26.09 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3036  response regulator receiver protein  24.1 
 
 
367 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697745  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  29.12 
 
 
467 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.68 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.9 
 
 
602 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  31.25 
 
 
543 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  28.3 
 
 
631 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.96 
 
 
526 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  24.93 
 
 
418 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1648  response regulator receiver protein  24.32 
 
 
367 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0057956  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  31.67 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.07 
 
 
507 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  25.85 
 
 
378 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2546  response regulator receiver protein  24.1 
 
 
376 aa  63.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  24.13 
 
 
380 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  27.54 
 
 
451 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.19 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1021  putative PAS/PAC sensor protein  29.21 
 
 
564 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.49 
 
 
606 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  25.34 
 
 
377 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  26.87 
 
 
472 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.1 
 
 
379 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.71 
 
 
379 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  24.81 
 
 
395 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  27.11 
 
 
533 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0833  response regulator  24.91 
 
 
389 aa  60.1  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106584  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2806  response regulator receiver protein  23.95 
 
 
373 aa  59.7  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1521  protein serine/threonine phosphatase  25.91 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2749  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  23.78 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2267  response regulator receiver protein  24.73 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0287525  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  23.78 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0583  response regulator receiver protein  26.56 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.7 
 
 
792 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  26.52 
 
 
519 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  27.76 
 
 
612 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  27.5 
 
 
644 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  27.31 
 
 
560 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1391  response regulator receiver protein  27.27 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  22.78 
 
 
362 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.52 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  29.8 
 
 
671 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.03 
 
 
590 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  26.98 
 
 
637 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  23.43 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2502  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149084  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0071  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  23.95 
 
 
426 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.11 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  28.18 
 
 
676 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.18 
 
 
389 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  27.52 
 
 
543 aa  57  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.09 
 
 
379 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.12 
 
 
384 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2688  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.52 
 
 
407 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2732  response regulator receiver protein  28.52 
 
 
407 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276002  normal  0.519614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2718  response regulator receiver protein  28.52 
 
 
407 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453118  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  25.6 
 
 
413 aa  56.6  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  22.11 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  23.85 
 
 
706 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  22.11 
 
 
358 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>