33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1466 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1466  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
596 aa  1181    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  35.17 
 
 
787 aa  233  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  34.12 
 
 
715 aa  190  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1059  von Willebrand factor type A  30.79 
 
 
625 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0405627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2528  von Willebrand factor type A  27.41 
 
 
622 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287943  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2397  hypothetical protein  27.27 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002774  hypothetical protein  25.85 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1824  hypothetical protein  25.9 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03209  hypothetical protein  26.09 
 
 
416 aa  66.6  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1710  von Willebrand factor type A  27.83 
 
 
698 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2110  hypothetical protein  24.69 
 
 
440 aa  63.9  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000434469  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2401  hypothetical protein  24.68 
 
 
444 aa  63.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000696992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2363  hypothetical protein  31.09 
 
 
481 aa  62  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000015183  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1879  hypothetical protein  24.06 
 
 
439 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00596429  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2606  hypothetical protein  29.63 
 
 
438 aa  54.3  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000605576  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02387  hypothetical protein  21.68 
 
 
498 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000501631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2203  hypothetical protein  23.87 
 
 
445 aa  50.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2557  hypothetical protein  25.2 
 
 
479 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  26.64 
 
 
607 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1994  hypothetical protein  27.78 
 
 
438 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000845172  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2016  hypothetical protein  22.22 
 
 
457 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000139386  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1781  hypothetical protein  24.39 
 
 
455 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000015299  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2001  hypothetical protein  22.22 
 
 
457 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000125665  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2233  hypothetical protein  24.39 
 
 
474 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000634383  normal  0.29326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.72 
 
 
1033 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  27.06 
 
 
605 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2322  hypothetical protein  27.84 
 
 
457 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0247486  hitchhiker  0.0000407236 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2156  hypothetical protein  25.23 
 
 
474 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000672621  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2017  hypothetical protein  28.87 
 
 
440 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2256  hypothetical protein  21.79 
 
 
455 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147191  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2064  hypothetical protein  26.8 
 
 
457 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000323531  hitchhiker  0.000809606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.91 
 
 
418 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.91 
 
 
418 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>