104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1413 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1413  Hydantoin racemase-like protein  100 
 
 
262 aa  539  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6766  Hydantoin racemase-like protein  32.43 
 
 
276 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.09 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  32.39 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.16 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  29.21 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  27.39 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  27.63 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  28.64 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.31 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  29.41 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  30.46 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  26.07 
 
 
242 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  22.98 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  27.66 
 
 
250 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  27.9 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2031  putative hydantoin racemase  27.18 
 
 
252 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.78 
 
 
285 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.38 
 
 
245 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  26.81 
 
 
247 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  27.92 
 
 
249 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6268  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.97 
 
 
262 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.78 
 
 
245 aa  62  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  26.32 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  29.31 
 
 
242 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  26.63 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  29.35 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  26.72 
 
 
243 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  29.31 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  25.53 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  29.31 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3252  hypothetical protein  25.73 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.31 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  30.18 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.61 
 
 
242 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  25.95 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.47 
 
 
247 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.73 
 
 
244 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.32 
 
 
242 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.17 
 
 
248 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.88 
 
 
245 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.88 
 
 
245 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.47 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.94 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  26.18 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  26.18 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  26.34 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  25.89 
 
 
327 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  26.34 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  26.34 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  25.89 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.99 
 
 
250 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  22.47 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2261  racemase, putative  26.39 
 
 
238 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113318  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  25.89 
 
 
318 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.18 
 
 
251 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  26.92 
 
 
261 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  25 
 
 
288 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  27.54 
 
 
263 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  27.17 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.58 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4863  Hydantoin racemase-like protein  25.14 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  normal  0.546582 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  27.32 
 
 
627 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  25.38 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1409  Asp/Glu racemase  29.56 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0168107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.14 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.11 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  24.79 
 
 
288 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  27.54 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  27.54 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0971  Asp/Glu racemase  23.72 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0912948  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.51 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.23 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.6 
 
 
250 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  27.04 
 
 
279 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4489  hypothetical protein  29.24 
 
 
262 aa  52.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  24.86 
 
 
254 aa  52.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.05 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  29.3 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  23.2 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2076  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.56 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.491688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.71 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  25.99 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  29.63 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  23.97 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  29.73 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  28.89 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2139  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.99 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0396546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3417  Asp/Glu racemase  25 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0199  Hydantoin racemase-like  26.19 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  27.69 
 
 
220 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  27.69 
 
 
220 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  27.69 
 
 
220 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1006  Asp/Glu racemase  39.73 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719563  hitchhiker  0.00113636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4294  Asp/Glu racemase  27.08 
 
 
252 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3409  hypothetical protein  30.66 
 
 
219 aa  45.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.89 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1556  Asp/Glu racemase  39.74 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  27.22 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.57 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>