160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1365 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  35.56 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  33.19 
 
 		 264 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  32.77 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  32.57 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  31.92 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  36.36 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  34.85 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  29.91 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  29.58 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2710  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 116 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0766  Cro/CI family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 106 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.047378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  29.82 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  34.38 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  29.91 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  28.63 
 
 		 302 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1907  putative DNA-binding repressor transcription regulator protein  47.62 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  30.28 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  35.56 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0314  XRE family transcriptional regulator  60.34 
 
 		 116 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000214612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0797  XRE family transcriptional regulator  60.34 
 
 		 116 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000538753  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  28.57 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  29.6 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4866  XRE family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894538  normal  0.194277 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  31.36 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  25.87 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  30.54 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2310  XRE family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 130 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000103087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27.73 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2276  XRE family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  30.91 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  25.87 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3025  DNA-binding protein, putative  39.42 
 
 		 120 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4178  helix-turn-helix domain-containing protein  45.57 
 
 		 130 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.886419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4829  XRE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 123 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.584136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3337  XRE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 123 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98805  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  34.81 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  29.55 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3047  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50.82 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  27.31 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  30.48 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  27.71 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  31.41 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3673  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151534  hitchhiker  0.000000782403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.14 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4100  Cro/CI family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.394089  normal  0.0554933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1764  helix-turn-helix domain-containing protein  45.31 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226226 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  32.31 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3376  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  27.88 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  27.11 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  28.57 
 
 		 256 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  33.33 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4463  XRE family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 117 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3181  transcriptional regulator, putative  47.54 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  27.11 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  33.33 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0177  putative DNA-binding repressor transcription regulator protein  52.94 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  26.67 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2619  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000698613  hitchhiker  0.000000000219561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2585  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00026111  hitchhiker  0.00000611184 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  29.37 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  25.38 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  28.3 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  23.76 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1627  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  28.43 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  30.62 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01337  phage-related protei  46.15 
 
 		 143 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  27.2 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1700  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3316  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0996495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  28.18 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1608  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  30.86 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  33.59 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  27.94 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  41.3 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0405  hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000114125  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  25.58 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.98 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  30.58 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  27.14 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3391  putative prophage repressor  26.67 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711365  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  32.82 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2905  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 134 aa  52.4  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0131008  normal  0.248064 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  25.71 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  32.17 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  23.45 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  26.52 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  26.57 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>