40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1355 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1355  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  328  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749221  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2158  thioesterase, putative  33.1 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03973  thioesterase domain, putative subfamily  33.33 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1720  thioesterase domain protein  31.65 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0960141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03531  fused GNAT family acetyltransferase/PaaI-related uncharacterized conserved domain  31.47 
 
 
304 aa  67.8  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123025  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0132  thioesterase domain protein  34.38 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1791  thioesterase domain protein  31.21 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3949  thioesterase domain-containing protein  29.1 
 
 
308 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3028  hypothetical protein  30.3 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3541  thioesterase domain-containing protein  27.56 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4948  thioesterase domain-containing protein  32.81 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625869  hitchhiker  0.0000169868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0286  thioesterase, putative  34.17 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0287  thioesterase domain-containing protein  33.62 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4614  thioesterase domain-containing protein  30 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00595  acetyltransferase  28.79 
 
 
300 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0262  hypothetical protein  32.76 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0142583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0277  thioesterase domain-containing protein  32.76 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001898  galactoside O-acetyltransferase  28.36 
 
 
305 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0420  thioesterase domain-containing protein  30.84 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0306  thioesterase domain-containing protein  30.32 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00971414  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3905  thioesterase domain-containing protein  26.43 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000215203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5400  hypothetical protein  32.09 
 
 
158 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4939  hypothetical protein  31.03 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0318  thioesterase domain-containing protein  33.02 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000336886  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0324  thioesterase domain protein  32.08 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304239  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0319  thioesterase domain-containing protein  32.69 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00732818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0323  thioesterase domain-containing protein  32.69 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.42127  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0315  thioesterase domain-containing protein  32.73 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00708885  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2722  thioesterase domain protein  25.17 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3401  acetyltransferase  28.57 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0333  thioesterase domain-containing protein  25.19 
 
 
164 aa  47.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0902  acetyltransferase  28.97 
 
 
298 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4397  acetyltransferase  28.44 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3704  thioesterase domain-containing protein  29.36 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120731  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0320  thioesterase domain-containing protein  30.28 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127147  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2936  putative acyltransferase  23.78 
 
 
299 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2312  hypothetical protein  25.93 
 
 
310 aa  43.9  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1324  thioesterase domain-containing protein  27.7 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.317856  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0274  thioesterase domain-containing protein  23.24 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3446  thioesterase, putative  25.17 
 
 
192 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000290362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>