More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1329 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  63.38 
 
 
917 aa  1013  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  64.35 
 
 
905 aa  1112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  61.94 
 
 
895 aa  1089  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  100 
 
 
893 aa  1779  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  62.7 
 
 
912 aa  1120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0334  nitrate transporter  64.96 
 
 
475 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.63846e-15 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0604  MFS nitrate/nitrite transporter NarK  63.47 
 
 
459 aa  588  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1233  nitrite extrusion protein 2  65.33 
 
 
468 aa  582  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13770  nitrite extrusion protein 2  65.11 
 
 
468 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  69.93 
 
 
452 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0665  nitrite transporter  63.03 
 
 
460 aa  582  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3863  major facilitator transporter  61.36 
 
 
477 aa  573  1e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2237  nitrite transporter  62.28 
 
 
472 aa  568  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532951  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0208  nitrite transporter  65.04 
 
 
457 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2657  nitrite transporter  64.38 
 
 
457 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5001  nitrate transporter  61.79 
 
 
461 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0909431  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6183  cyclic nucleotide-binding protein  60.68 
 
 
469 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0259908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1855  nitrate/nitrite transporter NarK  61.79 
 
 
461 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2755  nitrate/nitrite transporter NarK  61.35 
 
 
461 aa  529  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2240  nitrite extrusion protein  61.14 
 
 
490 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2623  nitrite extrusion protein  61.35 
 
 
490 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2679  nitrite extrusion protein  61.35 
 
 
490 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1512  nitrite extrusion protein  61.14 
 
 
461 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.85958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3079  nitrite extrusion protein  61.14 
 
 
461 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1730  nitrate/nitrite transporter NarK  61.14 
 
 
461 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2073  nitrate transporter  61.14 
 
 
460 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741347  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0973  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  62.23 
 
 
461 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3590  nitrite transporter  61.98 
 
 
461 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494502  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4667  nitrite transporter  61.98 
 
 
461 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.885517  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1775  nitrite transporter  59.13 
 
 
475 aa  516  1e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1704  nitrite transporter  59.34 
 
 
475 aa  515  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0932912  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2174  nitrate transporter  58.63 
 
 
475 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.642939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0660  nitrite transporter  62.58 
 
 
487 aa  505  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  57.27 
 
 
441 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  62.14 
 
 
443 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0426  nitrite transporter  62.58 
 
 
481 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0435  nitrite transporter  62.37 
 
 
481 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1108  nitrite transporter  61.08 
 
 
486 aa  486  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1768  nitrite transporter  51.8 
 
 
468 aa  469  1e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  59.57 
 
 
453 aa  466  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01211  hypothetical protein  52.48 
 
 
463 aa  460  1e-128  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1707  nitrite extrusion protein 1  52.48 
 
 
463 aa  460  1e-128  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135678  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1916  nitrite extrusion protein 1  52.7 
 
 
463 aa  460  1e-128  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184588  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1391  nitrite extrusion protein 1  52.48 
 
 
463 aa  460  1e-128  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00798499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1333  nitrite extrusion protein 1  52.48 
 
 
463 aa  460  1e-128  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000558307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2400  nitrite transporter  52.48 
 
 
463 aa  460  1e-128  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  2.37674e-05 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01201  nitrate/nitrite transporter  52.48 
 
 
463 aa  460  1e-128  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2422  nitrite transporter  52.48 
 
 
463 aa  460  1e-128  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  61.61 
 
 
460 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1374  nitrite extrusion protein 1  52.71 
 
 
461 aa  459  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0787741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  60.76 
 
 
460 aa  453  1e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2316  nitrite transporter  50.97 
 
 
465 aa  455  1e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.95434  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1960  nitrite extrusion protein 1  50.64 
 
 
465 aa  447  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0440291  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2898  nitrite transporter  54.27 
 
 
462 aa  448  1e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  55.88 
 
 
402 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1558  nitrite extrusion protein 1  50.54 
 
 
465 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431226  normal  0.0433169 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1375  nitrite extrusion protein 1  50.54 
 
 
465 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0207934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1901  nitrite extrusion protein 1  50.54 
 
 
465 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0276869  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1896  nitrite extrusion protein 1  50.54 
 
 
465 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0112468  normal  0.326955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  59.86 
 
 
459 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2301  nitrite transporter  53.02 
 
 
472 aa  439  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2225  nitrite transporter  53.24 
 
 
472 aa  439  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190366  normal  0.0765968 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  59.18 
 
 
426 aa  439  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1850  nitrite transporter  52.01 
 
 
463 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1705  nitrite extrusion protein 2  53.22 
 
 
462 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0635768  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2187  nitrite transporter  53.22 
 
 
462 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74785  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1553  nitrite extrusion protein 2  53.22 
 
 
462 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.615088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01439  hypothetical protein  53.22 
 
 
462 aa  426  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1650  nitrite extrusion protein 2  52.99 
 
 
462 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01427  nitrate/nitrite transporter  53.22 
 
 
462 aa  426  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2079  nitrite extrusion protein 2  53.22 
 
 
462 aa  426  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2178  nitrite transporter  52.99 
 
 
462 aa  426  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2260  nitrite transporter  50 
 
 
462 aa  422  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2566  nitrite transporter  48.29 
 
 
462 aa  417  1e-115  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1691  nitrite extrusion protein 2  52.63 
 
 
462 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1766  nitrite extrusion protein 2  52.63 
 
 
466 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.408584  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1754  nitrite extrusion protein 2  52.63 
 
 
466 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495939  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1693  nitrite extrusion protein 2  52.63 
 
 
466 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1585  nitrite extrusion protein 2  52.85 
 
 
466 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2061  nitrite transporter  49.67 
 
 
463 aa  407  1e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3598  nitrite transporter  57.96 
 
 
699 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0417643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1709  NO3-/NO2- ABC transporter  48.45 
 
 
458 aa  395  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  50.59 
 
 
431 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  50.35 
 
 
431 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  54.48 
 
 
413 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  47.23 
 
 
420 aa  372  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  54.57 
 
 
422 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  53.73 
 
 
424 aa  354  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  45.71 
 
 
426 aa  352  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  45.43 
 
 
426 aa  352  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2725  major facilitator superfamily MFS_1  47.23 
 
 
457 aa  352  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  45.71 
 
 
426 aa  352  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1769  major facilitator superfamily MFS_1  44.7 
 
 
475 aa  349  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00234233  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  45.48 
 
 
440 aa  347  7e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2802  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 
476 aa  342  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  45.59 
 
 
417 aa  342  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  45.15 
 
 
428 aa  340  7e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 
435 aa  340  9e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  44.92 
 
 
436 aa  339  1e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  43.14 
 
 
424 aa  338  3e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>