More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1304 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  286  7e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  47.52 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  47.14 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  45.32 
 
 		 173 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  46.46 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  46.46 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  46.46 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  47.86 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  42.36 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  44.09 
 
 		 141 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  44.09 
 
 		 141 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  44.09 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  44.09 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  44.09 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  43.31 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  43.31 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  48 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  43.31 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  43.31 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  43.31 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  43.31 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  43.31 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  43.31 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  43.31 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  48.8 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  48 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  45.67 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  47.24 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 176 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  44.53 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 176 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  45.65 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  49.15 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  49.15 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  47.46 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  47.46 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  48.31 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  42.52 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  48.31 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  44.7 
 
 		 132 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  43.2 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 172 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  42.74 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  38.35 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.98 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.98 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.98 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 128 aa  90.9  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  44.62 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  38.76 
 
 		 159 aa  89.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  43.52 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  33.33 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  43.52 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  36.72 
 
 		 186 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.25 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.25 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>