More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1293 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  58.59 
 
 		 189 aa  155  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  54.7 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  43.46 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  48.8 
 
 		 156 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  49.58 
 
 		 150 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  48.06 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  50.86 
 
 		 162 aa  135  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  38.33 
 
 		 191 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  50.4 
 
 		 164 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  50.4 
 
 		 164 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  50.4 
 
 		 154 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  50.4 
 
 		 164 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  44.78 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  45.11 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  51.82 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  53.64 
 
 		 154 aa  132  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  39.66 
 
 		 166 aa  131  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  51.82 
 
 		 159 aa  131  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  51.82 
 
 		 159 aa  131  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  51.82 
 
 		 159 aa  131  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  43.61 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  43.61 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  38.37 
 
 		 172 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  45.52 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  36.22 
 
 		 189 aa  127  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  54.39 
 
 		 148 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  34.59 
 
 		 190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  34.59 
 
 		 190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  34.59 
 
 		 190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  36.84 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  40.53 
 
 		 155 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  47.24 
 
 		 154 aa  124  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  50.43 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  50 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 		 147 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  50.43 
 
 		 154 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  50.43 
 
 		 154 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  50.43 
 
 		 154 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 		 147 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  50.43 
 
 		 154 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  53.64 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  52.73 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  48.03 
 
 		 143 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  48.03 
 
 		 154 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  49.57 
 
 		 154 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  48.03 
 
 		 154 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  49.57 
 
 		 154 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  49.57 
 
 		 154 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  49.57 
 
 		 154 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  44.53 
 
 		 154 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  44.53 
 
 		 154 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  44.53 
 
 		 154 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  44.53 
 
 		 154 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  44.53 
 
 		 154 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  40.3 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  39.55 
 
 		 191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  51.82 
 
 		 154 aa  115  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  46.02 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  44.96 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  40.68 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 173 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  31.41 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  43.84 
 
 		 181 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 150 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  35.95 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  43.15 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  35.34 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  48.65 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  48.65 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 177 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  36.21 
 
 		 273 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  36.21 
 
 		 273 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  36.21 
 
 		 273 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  50.89 
 
 		 133 aa  101  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  36.21 
 
 		 273 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  34.76 
 
 		 232 aa  101  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  36.21 
 
 		 273 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  32.82 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  35.42 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  32.07 
 
 		 275 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0391  NlpC/P60 family protein  36.17 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  44.95 
 
 		 153 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>