170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1226 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
209 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.19 
 
 
214 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.35 
 
 
211 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  50.73 
 
 
374 aa  154  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.71 
 
 
211 aa  154  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.67 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.06 
 
 
211 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.81 
 
 
215 aa  148  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.05 
 
 
212 aa  145  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  35.51 
 
 
218 aa  139  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  38.94 
 
 
210 aa  134  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  36.36 
 
 
212 aa  132  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.5 
 
 
231 aa  118  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.42 
 
 
230 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  34.12 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.33 
 
 
209 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  30.33 
 
 
209 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  30.33 
 
 
209 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  30.84 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  30.81 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  34.27 
 
 
218 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  28.44 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  33.49 
 
 
215 aa  85.1  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.39 
 
 
220 aa  84.7  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  31.36 
 
 
221 aa  81.3  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  30.99 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  28.37 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  30.3 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.18 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  33.33 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  30.66 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  32.88 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  29.65 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  30.84 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  26.73 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  23.71 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.84 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.39 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.98 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  32.65 
 
 
288 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.71 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
219 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.19 
 
 
320 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.76 
 
 
211 aa  62.4  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745456  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  28.86 
 
 
332 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  26.53 
 
 
291 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  30.61 
 
 
314 aa  59.7  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  22.34 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.17 
 
 
320 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  33.57 
 
 
309 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
222 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
228 aa  58.5  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  24.42 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.86 
 
 
324 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  27.89 
 
 
321 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.19 
 
 
324 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.53 
 
 
320 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  24.37 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.17 
 
 
320 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.86 
 
 
320 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.5 
 
 
320 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
225 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
218 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  26.4 
 
 
300 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  26.17 
 
 
323 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  26.17 
 
 
323 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  27.04 
 
 
228 aa  54.7  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.53 
 
 
320 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  27.14 
 
 
287 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.19 
 
 
328 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>