205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1150 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  100 
 
 
418 aa  830    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  58.23 
 
 
409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  56.57 
 
 
412 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  56.34 
 
 
412 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  56.57 
 
 
412 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  57.45 
 
 
414 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  57.66 
 
 
409 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  56.57 
 
 
412 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  57.45 
 
 
414 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  56.26 
 
 
414 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  38.03 
 
 
414 aa  296  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  42.18 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  39.05 
 
 
407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  38.62 
 
 
467 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  41.47 
 
 
419 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  40.52 
 
 
428 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  36.87 
 
 
415 aa  236  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  36.47 
 
 
415 aa  235  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  36.71 
 
 
415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  32.84 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  34.16 
 
 
506 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  33.25 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  33.67 
 
 
418 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  33.7 
 
 
411 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.41 
 
 
416 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  34.56 
 
 
408 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  33.69 
 
 
414 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  37.83 
 
 
406 aa  176  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  33.5 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  31.48 
 
 
483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  33.67 
 
 
400 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  30.91 
 
 
515 aa  173  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  34.27 
 
 
400 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  34.27 
 
 
400 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  34.27 
 
 
400 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  34.27 
 
 
400 aa  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  33.24 
 
 
409 aa  172  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  34.27 
 
 
400 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  34.27 
 
 
400 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  34.99 
 
 
400 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  32.15 
 
 
442 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  34.27 
 
 
400 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  33.77 
 
 
409 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  34.63 
 
 
414 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  34.63 
 
 
414 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  32.82 
 
 
408 aa  170  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  32.84 
 
 
414 aa  169  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  33.98 
 
 
404 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  32.66 
 
 
408 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  31.2 
 
 
414 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  34.35 
 
 
414 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  31.49 
 
 
410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  31.57 
 
 
410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  30.92 
 
 
498 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  31.46 
 
 
401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  33.52 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  31.97 
 
 
410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  33.24 
 
 
400 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  33.24 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  32.95 
 
 
400 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  34.64 
 
 
425 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  32.22 
 
 
410 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  32.66 
 
 
400 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  29.67 
 
 
410 aa  159  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  34.56 
 
 
517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.11 
 
 
528 aa  153  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  35.21 
 
 
537 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  31.76 
 
 
410 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  36.73 
 
 
392 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  36.26 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  31.18 
 
 
381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  31.18 
 
 
381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  37.16 
 
 
381 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  31.41 
 
 
381 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  31.81 
 
 
425 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  31.18 
 
 
381 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  35.14 
 
 
381 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  32.77 
 
 
406 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  31.49 
 
 
377 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.48 
 
 
435 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  33.97 
 
 
390 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  33.22 
 
 
381 aa  133  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  31.43 
 
 
381 aa  132  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  31.17 
 
 
379 aa  132  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  36.86 
 
 
381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  26.69 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.13 
 
 
400 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.69 
 
 
407 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.04 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  26.92 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.62 
 
 
400 aa  130  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  33.96 
 
 
380 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  34.31 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  33.45 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  29.93 
 
 
387 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  27.86 
 
 
409 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  26.97 
 
 
405 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  34.47 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  29.55 
 
 
375 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  31.72 
 
 
390 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>