More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1146 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1146  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 271 aa  559  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2616  GntR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  34.84 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  32.88 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  30.1 
 
 		 238 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  29.82 
 
 		 229 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  29.82 
 
 		 229 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  29.82 
 
 		 229 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  30.33 
 
 		 252 aa  95.9  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.26 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  30.26 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  30.26 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  30.26 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  30.26 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  27.44 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  30.26 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  30.26 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  30.26 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3766  GntR domain protein  32.35 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  30.54 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3478  GntR domain protein  31.25 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.554366 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  28.78 
 
 		 246 aa  92  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  29.13 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  31.67 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  31.44 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1867  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 245 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 238 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 238 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 238 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  29.58 
 
 		 240 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  30.28 
 
 		 239 aa  85.5  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  28.02 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.99 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  27.75 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  27.75 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  26.51 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  28.45 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4212  GntR domain protein  28.45 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  28.45 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000443765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  28.45 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5191  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000012685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4123  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860554  normal  0.0423809 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5704  GntR domain protein  29.05 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3616  GntR domain-containing protein  31.43 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.760095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  27.49 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  28.02 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  31.06 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  28.83 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  30.65 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  28.02 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  27.54 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1725  GntR domain protein  27.35 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  26.32 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1682  GntR domain-containing protein  28.81 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119908 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  28.44 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  29.06 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  27.51 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  29.07 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.5 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  29.66 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  28.31 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  27.49 
 
 		 239 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1667  GntR domain-containing protein  26.32 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0248117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  30.04 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3302  GntR domain protein  28.48 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2512  GntR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.109373 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  25.88 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  30.14 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  25.96 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173473  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0657  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  28.51 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  26.24 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  25.96 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  25.85 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  27.93 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.45 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>