More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1044 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  100 
 
 
721 aa  1466    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  46.85 
 
 
701 aa  640    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  50.7 
 
 
700 aa  683    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  47.13 
 
 
701 aa  642    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  44.33 
 
 
704 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  40.44 
 
 
723 aa  512  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  38.51 
 
 
718 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  40.56 
 
 
725 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  40.56 
 
 
725 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  39.51 
 
 
723 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  40.56 
 
 
725 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  40.56 
 
 
725 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  39.02 
 
 
723 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  39.02 
 
 
723 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  38.17 
 
 
809 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  36.01 
 
 
716 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 
728 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  37.14 
 
 
713 aa  428  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 
783 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  29.71 
 
 
717 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  30.36 
 
 
721 aa  268  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 
849 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  31.06 
 
 
704 aa  266  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 
716 aa  263  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  29.56 
 
 
713 aa  263  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 
710 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  31.43 
 
 
724 aa  249  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  39.57 
 
 
332 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 
738 aa  249  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 
817 aa  241  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 
697 aa  227  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  28.71 
 
 
714 aa  219  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 
739 aa  218  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  28.09 
 
 
771 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  30 
 
 
813 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  29.8 
 
 
816 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  26.48 
 
 
709 aa  206  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 
753 aa  201  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
742 aa  200  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  28.17 
 
 
764 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 
726 aa  198  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 
726 aa  197  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 
843 aa  197  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 
726 aa  196  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  27.82 
 
 
812 aa  194  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 
746 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 
732 aa  191  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 
745 aa  188  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 
745 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 
839 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 
745 aa  185  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
751 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 
758 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  26.68 
 
 
732 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  26.23 
 
 
723 aa  179  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  25.29 
 
 
723 aa  175  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  26.04 
 
 
733 aa  171  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 
698 aa  171  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  24.86 
 
 
755 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 
817 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 
808 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 
808 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.69 
 
 
676 aa  89.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  22.16 
 
 
693 aa  80.9  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  23.91 
 
 
647 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  29.57 
 
 
639 aa  77.4  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
728 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.8 
 
 
661 aa  75.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 
651 aa  74.7  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  37.3 
 
 
688 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
742 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.78 
 
 
754 aa  71.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 
653 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 
653 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 
708 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  25.25 
 
 
622 aa  69.7  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  23.07 
 
 
660 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  23.07 
 
 
660 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  32.96 
 
 
728 aa  68.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.43 
 
 
688 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 
762 aa  67.8  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 
688 aa  67.8  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  30.39 
 
 
618 aa  67.4  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 
653 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 
736 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 
729 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 
649 aa  65.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.82 
 
 
653 aa  64.7  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  22.99 
 
 
698 aa  64.7  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  22.78 
 
 
676 aa  64.3  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 
653 aa  64.3  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.18 
 
 
734 aa  64.3  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 
751 aa  63.9  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 
661 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 
707 aa  63.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.64 
 
 
676 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 
652 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  22.64 
 
 
676 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 
723 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  32.12 
 
 
668 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>