225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1029 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  100 
 
 
250 aa  507  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  71.6 
 
 
249 aa  359  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  70.37 
 
 
258 aa  352  3e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  66.12 
 
 
250 aa  352  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  68.72 
 
 
259 aa  350  9e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  69.96 
 
 
259 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  69.96 
 
 
258 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37270  LamB/YcsF family protein  70.54 
 
 
247 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000305457  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3199  LamB/YcsF family protein  69.71 
 
 
247 aa  339  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  62.55 
 
 
250 aa  296  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  62.14 
 
 
251 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  61.73 
 
 
251 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  59.26 
 
 
247 aa  282  4e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0361  LamB/YcsF family protein  53.31 
 
 
256 aa  273  2e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.135278  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  51.87 
 
 
242 aa  272  5e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  52.5 
 
 
246 aa  269  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1497  LamB/YcsF family protein  54.81 
 
 
246 aa  265  7e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.910801  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1983  LamB/YcsF family protein  51.48 
 
 
241 aa  263  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05795  LamB/YcsF family protein  49.37 
 
 
251 aa  253  1e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1436  LamB/YcsF family protein  50.42 
 
 
246 aa  250  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3547  LamB/YcsF family protein  48.75 
 
 
243 aa  249  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000162  lactam utilization protein LAMB  47.7 
 
 
251 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.078695  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  47.72 
 
 
257 aa  235  5e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  49.17 
 
 
254 aa  228  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1736  LamB/YcsF family protein  43.7 
 
 
242 aa  228  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  48.12 
 
 
258 aa  226  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 
255 aa  224  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  47.11 
 
 
254 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  43.98 
 
 
253 aa  221  1e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  44.17 
 
 
253 aa  221  1e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  43.75 
 
 
253 aa  221  1e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  47.08 
 
 
252 aa  220  2e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  43.75 
 
 
253 aa  219  2e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  43.33 
 
 
253 aa  220  2e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  43.33 
 
 
253 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 
255 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  43.33 
 
 
253 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 
255 aa  219  4e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01080  LamB/YcsF family protein  46.28 
 
 
245 aa  218  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 
254 aa  218  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  43.51 
 
 
254 aa  218  8e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 
252 aa  218  8e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  42.45 
 
 
253 aa  218  8e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  49.37 
 
 
250 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 
254 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 
255 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  46.25 
 
 
256 aa  216  3e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  43.33 
 
 
253 aa  215  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  42.19 
 
 
250 aa  214  1e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  42.19 
 
 
250 aa  214  1e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  49.79 
 
 
264 aa  213  2e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  47.92 
 
 
252 aa  213  3e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  47.08 
 
 
251 aa  212  4e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  49.17 
 
 
253 aa  212  6e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  46.96 
 
 
254 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  46.86 
 
 
255 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  43.51 
 
 
252 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  43.93 
 
 
255 aa  209  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  49.37 
 
 
251 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  49.33 
 
 
255 aa  208  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  39.09 
 
 
252 aa  208  6e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  48.95 
 
 
257 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  46.67 
 
 
252 aa  205  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  41.67 
 
 
256 aa  205  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  46.67 
 
 
256 aa  204  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 
257 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  46.25 
 
 
250 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  43.1 
 
 
250 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 
255 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  43.33 
 
 
255 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  48.52 
 
 
255 aa  201  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  42.86 
 
 
253 aa  200  2e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 
258 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  48.54 
 
 
304 aa  199  4e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 
256 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  45.04 
 
 
255 aa  198  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  40.42 
 
 
251 aa  198  8e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  43.75 
 
 
254 aa  196  2e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  43.75 
 
 
254 aa  196  2e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 
254 aa  196  2e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  43.75 
 
 
254 aa  196  2e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 
254 aa  197  2e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  45.76 
 
 
260 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  46.89 
 
 
301 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  50.22 
 
 
252 aa  196  4e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  42.32 
 
 
254 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4034  LamB/YcsF family protein  42.08 
 
 
253 aa  194  8e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  43.33 
 
 
256 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  47.03 
 
 
255 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 
256 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  50.42 
 
 
270 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  45.61 
 
 
252 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  43.98 
 
 
256 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  43.67 
 
 
255 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  47.26 
 
 
249 aa  191  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  42.5 
 
 
256 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 
246 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  39.33 
 
 
255 aa  189  3e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 
246 aa  189  3e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 
256 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.815905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>