More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1027 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  642    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 320 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 316 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  36.2 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  34.33 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0814  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.35587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2198  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1564  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2111  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0603  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3810  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430923 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2039  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0718  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 298 aa  125  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1695  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3151  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  27.33 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7727  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4745  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.729487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5155  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1775  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0671659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2150  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.26 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.651941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2124  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  29.26 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.797631  normal  0.149196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4814  transcriptional regulator, LysR family  28.15 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 320 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2259  LysR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0960  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3293  transcriptional regulator, LysR family  28.06 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1845  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102688 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0788  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  28.88 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0569  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  37.32 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2980  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0695506  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2476  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 295 aa  97.1  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.985162  normal  0.348723 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4978  LysR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0080  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 303 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  39.58 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2122  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3119  transcriptional regulatory protein  35.62 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234841  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3560  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 287 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1058  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2214  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 287 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>