More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0948 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  100 
 
 		 413 aa  829    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  40.65 
 
 		 391 aa  242  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.24 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  33.24 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1921  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.91 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1559  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  30.77 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0416  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  33.15 
 
 		 367 aa  192  9e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  30.37 
 
 		 386 aa  190  5e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1590  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  32.58 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0390  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  32.08 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  34.93 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  34.02 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 		 417 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.52 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1622  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.11 
 
 		 415 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.1162  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  34.26 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  38.34 
 
 		 383 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.8 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  32.53 
 
 		 430 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  33.69 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  31.45 
 
 		 414 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  32.49 
 
 		 366 aa  176  9e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  33.97 
 
 		 368 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.49 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  31.82 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  34.78 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  34.22 
 
 		 379 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  33.77 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4636  secretion protein HlyD  35.88 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  33.77 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  33.78 
 
 		 388 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00182  acriflavine resistance protein a precursor  32.7 
 
 		 381 aa  170  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  35.65 
 
 		 430 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  32.24 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  32.54 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0119  CmeA  28.38 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1409  RND family efflux transporter MFP subunit  37.89 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  34.47 
 
 		 393 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  34.13 
 
 		 383 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  34.26 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  32.87 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  35.41 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  31.44 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  32.4 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  32.84 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  33.07 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  30.32 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  33.07 
 
 		 411 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  31.2 
 
 		 410 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  33.78 
 
 		 400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  30.32 
 
 		 426 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  30.79 
 
 		 412 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  36.51 
 
 		 418 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  36.51 
 
 		 418 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  34.5 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  34.99 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  34.53 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  33.98 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.39 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  34.27 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.27 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  34.27 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  28.68 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  34.27 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4427  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.26 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  34.27 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  34.27 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  34.27 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  33.88 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  33.87 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  32.96 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.8 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  30.96 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  34.93 
 
 		 385 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3162  RND family efflux transporter MFP subunit  37.1 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000420577  unclonable  0.00000105041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  35.5 
 
 		 378 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  35.47 
 
 		 385 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  32.08 
 
 		 425 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.83 
 
 		 560 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.6 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  36.25 
 
 		 404 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  32.6 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  34.02 
 
 		 409 aa  159  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  32.22 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.28 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  34.9 
 
 		 387 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  30.48 
 
 		 411 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  35.97 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.34 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  32.22 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.12 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  32.33 
 
 		 412 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  32.22 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>