More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0824 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  623  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3767  LysR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  44.7 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0050  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.142799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1545  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.813324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2579  transcriptional regulator, LysR family  41.88 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1327  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.893209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2831  LysR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2813  LysR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2956  LysR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1094  LysR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  40.46 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1149  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.181713  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 298 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  40.7 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0225  transcriptional regulator, LysR family  38.24 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  39.45 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1033  LysR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 304 aa  212  7.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4019  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1113  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.800719  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0797  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.433602  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0120  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5764  LysR family transcriptional regulator  42 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  37.79 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4949  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0678  LysR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 324 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4560  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0686  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0593  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03790  Transcriptional regulator, LysR family  41.53 
 
 		 301 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1347  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278914  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  40.97 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  37.8 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 301 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2326  LysR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 317 aa  205  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231935  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 296 aa  205  8e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5143  transcriptional regulator, LysR family  42.72 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.05 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1984  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3363  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1672  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2693  LysR, substrate-binding  36.79 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.426832  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.45 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1256  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00128178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1186  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2695  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4211  transcriptional regulator, LysR family  37.87 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3529  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  38.25 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382378 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 305 aa  203  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>